国防工业企业是国家战略性产业，引领高新技术产业，在各国国防建设和经济建设中发挥着极其重要的作用，其自主创新能力的水平直接关系到国家核心竞争力的强弱。论文在自主创新理论中引入系统工程理论，构建了自主创新塔结构，以自主创新过程、要素及战略维度研究国防工业企业自主创新能力，为国防工业企业自主创新研究带来了新思路。首先，论文对自主创新能力研究的相关理论进行了综述。阐述了技术创新理论、技术能力理论、创新能力等自主创新能力有关理论，以及创新过程模型理论、系统工程理论等理论，明晰了自主创新能力的理论渊源及其内涵、特点。其次，论文对我国国防工业企业自主创新能力体系进行了构建。在借鉴系统工程与创新过程模型理论的基础上，明确了国防工业企业自主创新能力的内涵及功能，提出了国防工业企业自主创新战略定位的原则，并从创新过程和创新要素两方面分析了国防工业企业自主创新能力的影响因素。第三，论文对我国国防工业企业自主创新能力进行评价。通过对自主创新能力评价指标的遴选，建立了基于BP神经网络的自主创新能力评价模型与基于数据包络分析(DEA)的自主创新绩效评价模型，以14家国防工业企业作为样本进行实证分析。第四，论文根据我国国防工业企业的发展现状及存在问题，从微观、宏观两方面提出相应的对策。微观层次上主要包括以下几方面的对策建议：厂长任期创新责任制、创新人才激励机制重整、积极探索新的筹资渠道及全面质量管理体系建设；宏观层次上主要包括以下几方面的对策建议：金融服务支持体系建设、社会化服务支持体系建设、财税支持体系建设及法律支持体系建设。