高海拔水生系统的生物多样性格局对探究人类活动的影响具有重要意义,但相关研究较少。长江源区是典型的高寒地区,生态系统脆弱敏感。作为河流水生生态系统的初级生产者,浮游生物具有重要的功能,是水生系统的重要生态指标。本研究于2018年3月和10月对长江源区10条典型河流的水环境和浮游生物群落进行了系统调查,探讨了浮游生物群落海拔模式以及驱动因子。主要研究结果:（1）共鉴定出浮游植物28属58种。其中以硅藻、绿藻和蓝藻物种数占优,分别占总数的79.3%、10.4%和8.6%。调查期间,长江源区浮游植物密度在6.06M04～39.90×104 cells·L-1之间,平均生物量为0.59 mg·L-1。人类活动与基本环境因子（陆地生产力和坡度）的协同效应是影响长江源区浮游植物群落的驱动因素。人类活动是影响浮游植物群落沿海拔梯度变化的主要驱动力,随着海拔的降低,人类活动对研究区域水生生态系统的干扰逐渐加剧。（2）共划分为13个浮游植物功能类群,并规定相对生物量大于5%的为代表性功能群:C、D、LO、MP、P、TB、X1、Y,其中D、LO、MP和P四个功能类群在每个断面均出现,且共占据了总生物量的91.8%。冗余分析法（RDA）分析结果表明:研究区域内的浮游植物功能群主要受TN、TP、NO2--N、EC、WT、Sal和DO等的影响。同时,根据研究区域内水体基本理化指标、氮磷营养盐水平以及浮游植物群落多样性指数,长江源区的水质评价等级主要为无污染以及轻度污染。（3）共检出浮游动物44种。其中以原生动物、桡足类占优,分别占总数的34.09%、27.27%。浮游动物密度平均为174.05 ind·L-1,生物量平均为0.36 mg·L-1。典范对应分析结果显示,长江源区浮游动物分布受水环境因子pH、TP和NO2--N影响。根据浮游动物优势种指示,长江源区水体处于寡营养状态。本研究选取长江源区典型干、支流河段为调查对象,为了填补高原地区河流水生浮游生物研究理论基础,以期为长江源区生态系统健康提供理论依据和技术支撑。