基于核磁共振的代谢组学在口腔致龋菌鉴定中的初步研究

来源 :四川大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:blyd831104
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
代谢组学(metabonomics/metabolomics)是20世纪90年代中期发展起来的一门对某一生物或细胞内所有低分子量代谢产物定性和定量分析的一门新学科。基于高分辨率的核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)技术是代谢组学研究的主要方法。其通过对完整器官或组织细胞内小分子代谢组分进行检测,得到生物体系的NMR图谱,结合模式识别(pattern recognition,PR)进一步分析NMR数据,能够反映代谢物信息的生物学意义。本研究的目的是通过采用基于~1H-NMR的代谢组学技术对口腔常见致龋菌变形链球菌(Streptococcus mutans,S.mutans)及粘性放线菌(Actinomyces viscosus,A.viscosus)在培养液中的胞外代谢产物检测,得到其特征性的~1H-NMR图谱,结合模式识别主成份分析法(principal component analysis,PCA)进行分析,希望能够区分两种细菌。实验过程为:1.实验菌株在改良培养基中的生长情况观察以S.mutans和A.viscosus为实验菌株,采用改良培养基培养,形态学观察和生化鉴定,绘制两菌在改良培养基中的生长曲线,以观察细菌在改良培养基中的生长情况。2.核磁共振谱图的获得将制备的细菌胞外代谢物样本,以内标法进行~1H-NMR分析,获得原始的自由感应衰减信号,导入MESTREC软件,进行傅立叶转换从而获得一维~1HNMR谱图。3.数据的主成份分析用MESTREC软件对每个样本的图谱积分均得到200个积分值,将原始积分值导入Excel表中,采用非监督方法主成分分析法(PCA)分析数据。结果:在改良培养基中,实验菌生长良好,表现出典型的形态、生化特征和稳定的生长曲线。NMR谱图宏观观察可以发现实验菌胞外代谢物的特征峰;模式识别观察到两种细菌胞外代谢物在主成份得分图上的各自的类聚性;载荷图分析得出能够区分两种细菌的胞外代谢物的化学位移值是位于7.08ppm、2.56ppm、0.8002ppm等物质。结论:基于~1H-NMR的代谢组学可以较好的将变形链球菌及粘性放线菌的胞外代谢物区分开来,代谢组学技术可以用于口腔微生物的鉴定。本研究为将基于核磁共振的代谢组学方法用于口腔细菌的快速鉴定及分类奠定了实验基础。
其他文献
人类社会进入新的21实际,知识经济时代即将到来,各国国力竞争正日趋激烈。众所周知,不论是知识创新还是技术创新,都离不开教育这一基础,而课堂教育又是教育的主阵地。为此本文结合英语课堂教学实际,对如何实施创新教育谈点拙见,共同商榷。  一、教学目标的创新  课堂教育必须有明确的主攻方向,这个主攻方向就是平常所说的教学目标,它是课堂教学活动的方向盘和指南针,也是课堂教育的起点和归宿。  1、目标的制定要
一、参考译文液压挖掘机在南非煤矿中的作用由于卓有成效、富于创新的研究,液压挖掘机已从单纯的建筑机械发展成为重要而可靠的露天采矿机械。大型液压设备(如液压泵、阀组
德育工作是一门科学,而且是一门艺术性科学。全面实行素质教育的今天,加强学生思想品德教育是十分必要的。而数学作为一门基础性学科,在其教学中渗入德育教学更是不可或缺的。作为数学老师,常常有这样的困惑:对学生进行德育教育否有更好更新颖的方法呢?注意到中学生具有很高的求知欲,学生和家长更多关注的是知识的学习,若能在平时的课堂教学过程中适当、适时、自然地渗透德育会起到事半功倍的效果。《数学课程标准》指出:数
目的:自从上世纪60年代以来利用口腔种植技术恢复咀嚼功能受到了越来越多的患者的认同,目前临床上所应用的种植材料主要是纯钛及钛合金。金属钛是一种生物材料,具有良好的生
瓦斯是一种以甲烷为主,多成分的混合气体,其成分CH_4约占63.1~99.22%,N占0.05~35.96%,CO_2占0.06~14.76%。甲烷为无色、无味、无嗅、无毒的气体,化学性稳定,比重比空气轻,当矿井瓦斯集中的
领导干部学习制度多种多样,而党校领导干部轮、培训学习制度无疑是最重要的一个方面。本文在对近几年成都市委党校县以上领导干部轮培训情况进行调查研究的基础上,拟对这种
【摘要】 德国的教育家第斯多德曾指出:“教学的艺术,不在于教授的本领,而在于激励、唤醒、鼓舞”,生动的教学情境的设置,不仅能引出教学内容的新鲜感来激发学生学习的兴趣,而且让学生在轻松愉快的心境下保持旺盛的学习热情,更重要是激发学生“我要学”、“我爱学”的课堂气氛,让学生在浓厚的氛围中愉快地接受新知识。  【关键词】 有效情境 激发 关注 尊重 创新精神  中国分类号:G633.6  建构主义学习理
目的比较郑州市区恒牙初期与恒牙期安氏Ⅰ类错(牙合)女性牙颌颅面硬软组织结构的异同,并将其均值分别与正常(牙合)均值比较,探讨其颅面形态特征、错(牙合)机制及发育规律,以期为
目的:选取五倍子、白芷和白芨三味中药的主要成份没食子酸、厚朴酚及白芨多糖三者配伍制成复方中药制剂,作用于浮游及生物膜状态下的感染根管内常见菌,观察其抗菌作用,探讨复方中
用类平均数值分类法 ,将八十遗址古稻分为七类十一群。各类间的性状平均值存在不同程度差异 ,表明古栽培稻具有类型的多样性 ,是一种非野非籼非粳的原始栽培稻复合体 (Com