双齿围沙蚕(Perinereis aibuhitensis)是一种营养价值极高的底栖生物。虽有许多文献研究均指出其体色有红色和绿色两种表型,但其体色差异原因及其机制以及二者间的生物学差异却尚未有系统性的研究报道。探究其体色的差异原因和二种表现型间的生物学差异以及产生其差异的基因的特异性表达对水产养殖的彩色物种选育等方面有着重大意义。本论文对我国滩涂习见的两种体色的双齿围沙蚕为研究对象,系统的开展了在呼吸代谢方面的代谢率相关对比研究、生化营养相关成分含量和营养评价对比研究以及转录组差异基因表达的对比研究。本次研究所得结果表明,在所设计的三个不同方面的对比实验中,这两种体色的双齿围沙蚕所测方面均有较为显著的差异。其中,在生态学呼吸代谢方面,以温度为变量对两色双齿围沙蚕的耗氧率和排氨率进行了对比研究,所得数据表明红色双齿围沙蚕的呼吸代谢较绿色双齿围沙蚕的呼吸代谢旺盛,且对环境变化如温度变化的响应红色双齿围沙蚕要比绿色双齿围沙蚕更为敏感。在生化成分(营养相关)方面,对各类生化成分(蛋白质、脂肪、总糖、氨基酸、脂肪酸、微量元素等)进行了系统的含量测量,将所得数据进行对比分析评价后得到,红色双齿围沙蚕在营养成分方面而言要比绿色双齿围沙蚕所含营养成分更为均衡和丰富。在基因分子表达方面,本实验对两色双齿围沙蚕进行不同部位进行取样分别得到体壁组和整体组的RNA样本,对其进行转录组测序和差异表达基因分析,所得两种体色双齿围沙蚕的转录组基因表达差异显著,在对其差异表达的基因进一步的分析表明,二者差异基因最多的是在细胞组分方面,差异最为显著的是在分子功能类。而对体壁组差异基因进行深入的分析与总结可初步推断,与二者体色差异明显相关的差异表达基因为虾青素和凝集素基因。