基于2010年9月~2012年8月两年逐月采用定置网和流刺网渔具对福建九龙江口水域鱼类群落的调查资料，分析了九龙江河口区鱼类生物群落特征，包括九龙江口鱼类生物的种类组成、数量变动、群落多样性、空间分布格局及其营养关系等动态变化，研究结果可为评价该河口生态系统及鱼类资源提供科学依据，研究结果如下:首先，本研究分析了该河口区的鱼类群落结构组成。共捕获鱼类234种，隶属于2纲19个目77科156属。其中以辐鳍鱼纲中的鲈形目（116种）占绝对优势，约占总种数的49.57%；鲤形目（22种）次之，约占总种数的9.40%；暖水性种类最多（59.8％）；暖温性次之（37.8％），冷温性种类最少（1.69％）。九龙江河口水域现有鱼类等级多样性指数△＋和分类差异变异指数∧＋分别为73.793和144.444。分类学等级多样性指数只有2011年9月份与总名录之间达到显著差异水平（P<0.05），其余月份的等级多样性指数和分类差异变异指数与总名录的差异均未到达到显著差异水平。其次，本研究对九龙江河口区2010年9月~2011年8月和2011年9月~2012年8月两年间鱼类群落组成差异进行了探讨。发现不同年间鱼类物种组成相差较大，2010年9月-2011年8月渔获鱼类202种，隶属2纲19目72科136属；其中鲈形目（107种）最多，鲤形目（20种）次之。2011年9月~2012年8月渔获鱼类160种，隶属1纲14目64科119属；鲈形目（81种），仍占绝对优势，鳗鲡目（16种）次之。多样性指数2010年9月~2011年8月较高于2011年9月~2012年8月，其平均值分别为3.368和3.364。九龙江河口区两年间鱼类丰度表现出明显的差异性。2010年9月~2011年8月定置网渔获鱼类平均生物量和丰度分别为35177.09g/网和15517ind/网；其中优势种有青鳞小沙丁鱼、眶棘双边鱼、前鳞鲻、中华小公鱼、斑鰶共5种，占总渔获量的48.15％；而2011年9月-2012年8月则分别40013.72g/网和18511ind/网，优势种为眶棘双边鱼、前鳞鲻、青鳞小沙丁鱼，占总渔获量的37％。再次，本研究对九龙江河口区不同盐度水域的鱼类群落结构进行了比较分析。结果显示岛美站位鱼类种类数最多（162种）；浮宫站位次之（147种）；紫泥站位种类最少（105种）。经统计检验，三个不同盐度水域间的种类数差异显著（P<0.05），反应了河口内部区域鱼类种数逐渐向外海增高的趋势。相似性分析显示九龙江河口三个不同盐度水域之间的鱼类组成，最相似的是中游（浮宫）水域的和上游（紫泥）水域的；下游（岛美）水域和上游（紫泥）生境差异较大；同一水体不同季节之间的相似性系数普遍高于不同盐度海域间的相似性系数值，这表明同一水体不同季节下,鱼类种类组成间的相似度要低于不同环境下水体之间的相似度。盐度是形成九龙江河口区鱼类种类组成的重要因素。最后，本研究对九龙江河口区鱼类种类的食性营养关系进行了初步分析。在九龙江水域收集了30种主要鱼类胃含物。结果显示，九龙江河口鱼类的食性分为6种类型：浮游生物食性、底栖生物食性、游泳动物食性、浮游生物和底栖生物食性、底栖生物和游泳动物食性及浮游生物和游泳动物食性；4个营养级：杂食性鱼类，低级肉食性鱼类,中级肉食性鱼类，高级肉食性鱼类。其中低级肉食性鱼类占绝对优势。