经营效率是一直以来都是企业管理实践界与理论界研究的热点,不仅反映着企业自身的经营状况,还在一定程度上反映着国民经济整体的运行效率。农业类上市公司作为农业产业化经营的重要形式,是我国现阶段先进农业生产力的代表,是资本市场与现代农业的有机结合,农业及其关联板块已成为我国证券市场上的重要板块。但近年来,我国农业类上市公司在持续发展的同时,也暴露出了如业绩偏低,总体规模较小以及产品科技含量较低等一系列问题。因此,在竞争日益激烈的国内外市场环境中,我国农业类上市公司经营表现如何?怎样正确评价其经营效率?农业类上市公司经营效率受那些因素的影响?等等问题都有待研究。基于此,本文选用数据包络分析法,构建了投入与产出二维指标体系,从综合效率、纯技术效率以及规模效率三个方面对我国56家农业类上市公司2009-2013年的经营效率进行了分析后发现,我国农业类上市公司经营效率普遍不高且两极分化明显,其中规模效率较低直接导致了经营效率偏低。基于评价结果,本文进一步运用面板数据的随机效应模型以企业运作与治理为切入点,分析了影响我国农业类上市公司经营效率的因素。研究结果显示,上市年龄、企业规模以及营运能力与农业类上市公司经营效率正相关；股权集中度、控股股东性质与其经营效率负相关,其中“一股独大”的股权结构影响较为显著。最后,基于实证研究结论,为进一步提高我国农业类上市公司的经营效率,本文从政府和企业两个层面提出了可行性建议。