SET8基因3'端非翻译区的miR-502结合位点单核苷酸多态性与肺癌患者临床特征及预后的关系

来源 :河北医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:hordark
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目的:肺癌已成为最常见的恶性肿瘤之一,在全球范围内,肺癌的总体发病率和病死率位居各类癌症之首,且呈不断上升趋势。MicroRNA(miRNA)是一类小型非编码RNA,人类基因组中大约有30%的蛋白编码基因是受其调控。单核苷酸多态性(Single NucleotidePolymorphism,SNP)是在基因组水平上,由单个核苷酸的变异引起的序列多态性,是不同个体间最主要的遗传变异。SET8基因mRNA3’端非编码区有miR-502的结合位点,单核苷酸多态位点rs16917496存在于SET8基因3’端非编码区miR-502的结合区域内,研究发现该位点参与调节SET8基因的表达,并与肿瘤的早期发生相关。本研究首次对SET8基因3’端非翻译区的miR-502结合位点SNP与肺癌患者临床特征及预后的相关性进行研究,同时分析了患者临床特征与预后的相关性,为肺癌预后的评价提供新的思路。  方法:采集2001年5月~2011年5月间就诊于河北医科大学第四医院呼吸内科的317例肺癌患者,所有患者均经组织病理和/或细胞病理确诊为肺癌,均排除肺外原发肿瘤及遗传性疾病史。按要求准确记录患者的性别、年龄、病理类型、临床分期、吸烟状况和治疗情况。对317例患者进行基因型分析,其中195例患者有准确生存数据,对其进行生存分析。血标本均为患者接受放、化疗之前空腹采集,采取静脉血5ml置于枸橼酸钠的试管中。采用蛋白酶K-氯化钠盐析法提取基因组DNA,经鉴定DNA合格后,采用聚合酶链反应对目的片段进行扩增,扩增产物使用连接酶反应(ligase detection reaction,LDR)技术,实现对SNP位点的检测,对SET8基因3’端非翻译区的miR-502结合位点单核苷酸多态位点进行基因分型。  对不同组别的肺癌患者中SNP分布频率分析采用x2检验,以非条件logistic回归方法计算相对风险度的比值比(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidence interval,CI)。单因素分析采用Kaplan-Meier方法估计组间生存率和绘制累计生存函数曲线,组间对比使用log-rank检验,筛选可能影响预后的危险因素。单因素分析有意义者,纳入Cox风险回归模型进行多因素分析,计算P值、相对危险度(Relative risk,RR)及其95%可信区间(confidence interval,CI),确定影响预后的独立危险因素。所有统计分析均采用SPSS18.0软件包进行,P<0.05被认为有统计学意义。  结果:  1全部研究对象中,男性占67.5%(214例),女性,占32.5%(103例),平均年龄59.09±10.67岁。≤60者占56.2%(178例),>60岁者占43.8%(139例)。肺鳞癌占26.8%(85例),肺腺癌占49.8%(158例),小细胞肺癌占23.4%(74例)。吸烟者占50.5%(160例),不吸烟者占49.5%(157例)。接受治疗者占85.8%(272例),未接受治疗者占14.2%(45例)。  有准确生存数据肺癌患者中,非小细胞肺癌共152例,男性占65.8%(100例),女性占34.2%(52例),平均年龄60.36±10.73岁。≤60者占48.0%(73例),>60岁者占52.0%(79例)。肺鳞癌占30.9%(47例),肺腺癌占69.1%(105例)。Ⅲ期占30.3%(46例),Ⅳ期占69.7%(106例)。吸烟者占48.7%(74例),不吸烟者占51.3%(78例)。接受治疗者占82.9%(126例),未接受治疗者占17.1%(26例)。小细胞肺癌共43例,男性占62.8%(27例),女性占37.2%(16例),平均年龄56.60±10.63岁。≤60者占67.4%(29例),>60岁者占32.6%(14例)。局限期占30.2%(13例),广泛期占69.8%(30例)。吸烟者占53.5%(23例),不吸烟者占46.5%(20例)。接受治疗者占93.0%(40例),未接受治疗者占7.0%(3例)。  2所有肺癌患者中,不同病理类型(NSCLC组与SCLC组,P=0.764,OR=1.061,95%CI=0.720-1.565;鳞癌组与腺癌组,P=0.121,OR=0.734,95%CI=0.496-1.085)、性别(男性患者与女性患者,P=0.485,OR=0.881,95%CI=0.618-1.257)、年龄(≤60岁与>60岁患者,P=0.729,OR=1.060,95%CI=0.761-1.478)、吸烟情况(吸烟患者与不吸烟患者,P=0.500,OR=0.893,95%CI=0.642-1.242)患者间,T、C等位基因分布频率差异均无统计学意义。  3所有肺癌患者中,不同病理类型(NSCLC组与SCLC组中TT、CT、CC基因型频率分别为29.6%、27.5%、7.7%和32.1%、22.3%、11.6%;鳞癌组与腺癌组TT、CT、CC基因型频率分别为25.9%、26.7%、10.4%和31.7%、27.9%、6.3%)、性别(男性患者与女性患者TT、CT、CC基因型频率分别为28.9%、26.8%、8.7%和35.2%、36.9%、29.0%)、年龄(≤60岁与>60患者TT、CT、CC基因型频率分别为30.9%、26.1%、8.5%和29.3%、26.5%、8.8%)、吸烟情况(吸烟患者与不吸烟患者TT、CT、CC基因型频率分别为28.7%、26.6%、9.0%和31.7%、25.9%、8.2%)患者之间,CT基因型、CC基因型及CT+CC基因型,与优势基因型TT相比,频率分布差异均无统计学意义(P值均>0.05)。  4非小细胞肺癌组,单因素分析,set8基因型(CC基因型,CT基因型,TT基因型,p=0.688)、性别(男性与女性,P=0.842)、年龄(≤60岁和>60岁,P=0.776)、病理类型(鳞癌与腺癌患者,P=0.403)、吸烟情况(吸烟者与不吸烟者,P=0.543),对预后影响差别无统计学意义。临床分期(Ⅲ期与Ⅳ期患者,P=0.003)、治疗情况(治疗组与未治疗组,P=0.000),对预后影响差别均有显著统计学意义。多因素分析显示,Ⅲ期与Ⅳ期患者相比,后者的死亡风险为前者的1.904倍(P=0.007,RR=1.904,95%CI=1.194-3.038)。治疗组与未治疗组相比,前者的死亡风险为后者的0.434倍(P=0.000,RR=0.434,95%CI=0.273-0.690)。  5小细胞肺癌组,单因素分析,性别(男性与女性,P=0.087)、临床分期(局限期与广泛期患者,P=0.939)、吸烟情况(吸烟者与不吸烟者,P=0.349),对预后影响差别均无统计学意义。SET8基因型CC+CT基因型和TT基因型,P=0.043)、年龄(≤60岁和>60岁,P=0.029)、治疗情况(治疗组与未治疗组,P=0.000);对预后影响差别均有统计学意义。多因素分析,性别与小细胞肺癌患者死亡风险无关(P=0.529,RR=1.291,95%CI=0.583-2.860)。年龄与小细胞肺癌患者死亡风险无关(P=0.122,RR=1.806,95%CI=0.855-3.816)。治疗组与未治疗组相比,前者的死亡风险为后者的0.059倍(P=0.000,RR=0.059,95%CI=0.012-0.287)。CC+CT基因型者与TT基因型者相比,前者的死亡风险为后者的0.438倍(P=0.031,RR=0.438,95%CI=0.207-0.926)。  结论:  1不同临床特征(包括病理类型、性别、年龄、吸烟状况)的肺癌患者,rs16917496多态位点基因型中,T、C等位基因及各基因型(TT、TC、CC)分布频率差别无统计学意义。  2 Set8基因3’端非翻译区的miR-502结合位点单核苷酸多态性与SCLC患者预后相关,SET8基因型可作为SCLC患者预后的独立危险因素,携带C等位基因的小细胞肺癌患者较只携带T等位基因的患者,有着较好的预后。  3尚不能认为Set8基因3’端非翻译区的miR-502结合位点单核苷酸多态性与NSCLC患者预后相关。  4治疗情况可作为NSCLC及SCLC患者预后的独立危险因素,治疗组与未治疗组相比,预后明显改善。  5 TNM分期可作为NSCLC患者预后的独立危险因素,Ⅲ期患者预后明显好于Ⅳ期患者。性别、年龄、病理类型及吸烟状况,尚不能成为NSCLC患者预后的独立危险因素。  6性别、年龄、临床分期及吸烟状况,尚不能成为SCLC患者预后的独立危险因素。
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