目的:通过回顾性对比分析高通量测序技术(mNGS)与传统病原体检测方法在支气管镜检查肺泡灌洗(BALF)标本中的差异,评估mNGS在肺部感染中的应用价值。方法:收集我院从2019年1月至9月入院诊断为肺部感染性疾病的40例患者,分为重症肺炎组20例及非重症肺炎组20例,收集其一般临床资料及炎症指标动态数据,将支气管镜操作后的BALF标本同时送检mNGS及传统病原体检测,比较mNGS组及传统检测组微生物的检出率及病原体阳性结果,并统计肺炎风险分级的相关因素。结果:mNGS可以同时检测和识别多种微生物,mNGS的微生物检出种类及数目均要多于传统方法组,mNGS的病原体检出灵敏度要高于传统检测方法。在传统检测病原体结果为阴性的23例样本中,有17例经mNGS检测呈阳性结果。mNGS联合传统检测指导药物治疗后,炎症指标WBC较前明显下降(P<0.05),N%及CRP较前显著下降(P<0.001)。最后,在肺炎风险相关因素对比分析中发现,重症肺炎组跟非重症肺炎组在基础疾病史、CRP跟N%的均值上具有明显统计学差异(P<0.05)。结论:mNGS在微生物的检出及病原体的鉴定方面均优于传统检测组,联合传统检测指导药物后疗效明显。此外,基础疾病病史、CRP及N%是影响患者肺炎风险分级的相关因素。