重庆早在抗日战争时期就建成了我国最早的工业基地之一，至今经过了几十年的发展建设，已经形成了一套基础稳固和设施完善的工业制造体系，并且多年来一直在重庆工业发展的进程中占据着重要的地位。但是从多年的发展到目前现状来看，重庆装备制造业在发展过程中存在的行业结构单一、核心企业数量少、技术创新能力弱、出口规模小的问题，如果这些问题长期得不到解决，将使得整个重庆进行老工业基地改造、新型工业化发展的速度受到严重制约。而经过年多的研究，模块化理论已经日渐成熟，并在工业实践中获得了较好的效果。因此，本文期望将模块化的思想引入到装备制造业的合作创新中，建构一个制造业模块化合作创新的模型，为重庆市装备制造业的升级转型找到方向。本文首先从国外和国内两个角度对论文所涉及到的合作创新理论和模块化理论进行综述，找到将模块化生产理论应用在合作创新中，能够促进创新活动的持续性，并能使合作双方保持长期稳定的合作关系的理论依据，为重庆装备制造业模块化合作创新的实施奠定了理论基础。然后，本文通过从产业规模、行业结构、经济效应和技术创新四个方面对重庆装备制造业多年发展情况的梳理，寻找在这当中存在的问题，并在此基础上提出重庆装备制造业进行模块化生产网络合作创新，改造和提升装备制造业实力的必要性。其次，从分析模块化合作创新实现的条件出发，构建模块化生产网络合作创新模型，分析模块化生产网络中特别的信息结构特征对创新的作用，并指出这种创新合作能带来产品创新、知识创新和价值创新效应。再次，运用博弈论的方法，从一次博弈和多次博弈合作角度分析模块化生产网络中的模块集成商和模块供应商通过长期合作这种机制将会自发的抑制交易双方的机会主义行为，使得各自在追求自身利益最大化的同时实现共同利益最大化。最后，结合重庆装备制造业的现状，一方面从装备制造业企业内部治理角度提出企业改进的方向；另一方面从模块化生产网络企业外部环境，主要是从产业政策和政府管制的角度提出政府政策的调整方向。这对重庆市装备制造业模块化改造促进合作创新，进而带来升级转型有重要的意义。