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目的 本实验设计通用引物扩增龈下菌斑全细菌16S rDNA片段,通过变性梯度凝胶电泳得到龈下菌群DNA图谱,动态观察龈下细菌治疗前后在口腔内定植的变化,为牙周病病因学的研究和临床治疗方案的确定提供实验依据。 方法 1.标本选择:龈下菌斑取自中国医科大学口腔医学院牙周病门诊成人牙周炎患者。实验对象选择年龄在30-55周岁之间、探诊深度3-6毫米、无全身系统疾病、未接受过牙周治疗、近两个月未服用任何抗生素和甾体类药物者,共26例。 2.治疗随访计划:患者首次就诊,以治疗前牙周状态为基线,取龈下菌斑;记录菌斑指数(Plaque Index,PlI)、牙龈出血指数(Bleeding On Probing,BOP)、牙齿松动度和牙槽骨吸收度,测量探诊深度(Probing Depth,PD);进行全口龈上洁治、龈下刮治、根面平整,嘱患者口服甲硝唑(200mg,TID)7天。治疗后一周、一个月和三个月时复查,取龈下菌斑,记录牙周临床指标。 3.标本采集:刮匙法。每个实验对象选取探诊深度在3-6mm之间的一颗牙齿作为研究对象,龈下刮治器刮取牙周袋的近中、远中、颊侧牙根面和软组织面各一下,置入含0.5ml无菌PBS溶液的Eppendorf管中,-70℃深冻冰箱保存。 4.统计学分析:应用SPSS11.0软件分析牙周临床指标在治疗前后是否有差异及相关性。 5.龈下菌斑DNA的提取及浓度测定:酚-氯仿法提取龈下菌斑全细菌 DNA,溶于 60 pl h。取 5 gi测量 DNA纯度及浓度,其余置一20℃冰箱保存。紫外分光光度仪分别测量260urn和280urn处吸光度值及比值。比值界于1.7-2.0之间,表示DNA纯度较好。按公式:DNA浓度(p砂…)=(A删 x 50 x稀释倍数*1000,对DNA进行定量分析。 6.PCR扩增:165 rDNA通用引物扩增全细菌 16s rDNA序列。设计含GC夹的引物,使扩增后的PCR产物在浓度递增的变性梯度凝胶中始终保持分叉状结构。豆%琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物。 7.变性梯度凝胶电泳(DGGE)观察龈下菌群DNA图谱。 7.1 垂直DGGE:制备0-100%垂直变性梯度凝胶,检测最适解链条件门变性浓度人 7.2 平行DGGE:根据垂直DGGE检测到的解链区域变性浓度,制备相应变性范围的平行梯度凝胶。动态观察治疗前后龈下菌群DNA图谱。 7.3 选择特异条带进行切胶、测序分析:选择治疗后减弱J失的两个DNA条带和治疗后新出现的两个条带,切胶、回收、克隆、纯化、测序。 结 果 二.牙周基础治疗前后临床指标的变化 1.126例成人牙周炎患者经牙周基础治疗后,临床症状明显改善,牙周临床指标均有下降。统计学分析表明 PllJOP、PD和牙齿松动度在治疗前后具有明显差异仔<o.0U。牙槽骨吸收度在治疗前后变化不明显,无统计学意义。龈下全细菌DNA浓度有下降趋势,这种差异不具有统计学意义。 1.2 Speannan相关分析表明BOP与PD具有重度正相关关 ·2·系h二O.71o,P<0.01人随着*D的降低,BOP指数减少;牙齿松动度与牙槽骨吸收度和 PD呈中重度正相关关系卜二 0.630刀.526,P<o.01人随着牙槽骨吸收度和PD的减少,牙齿松动度降低。 2.DGGE图像分析 变性梯度凝胶电泳成功地得到龈下菌群DNA图谱,可动态观察龈下菌群在基础治疗前后的变化:治疗后一个月DNA图谱变化明显,新带出现;治疗后三个月与治疗前在一定程度上相似。 3.测序结果 选取治疗前明显、治疗后减弱、消失的两个DNA条带,切胶、回收、克隆、纯化、测序。测序结果经GenBank的BLAST分析,表明它们的碱基序列与牙龈叶琳单胞菌(PorPhyromonas gingivnglis,Pg)的 16s rDNA序列片段有98%和99%的同源性;选择治疗后新出现的两个条带同上处理,结果表明它们的碱基序列与叶琳菌属 od clone cd34(po叩岭romonas sp.oral clone cM34)有99畅的同源性。 结 论 1.成人牙周炎患者牙周基础治疗后,临床症状明显改善。菌斑指数、牙龈出血指数、牙齿松动度和探诊深度在治疗前后具有明显差异瞩<0.01人牙槽骨吸收度在治疗前后变化不明显,无统计学意义。 2.Spearman相关分析表明BOP与PD具有重度正相关关系(r=o.*0,P<o.01),随着*D的降低,*OP指数减少;牙齿松动度与牙槽骨吸收度和 PD呈中重度正相关关系卜一0.630刀.526,P<0.01L随着牙槽骨吸收度和*D的减少,牙齿松动度降低。 3.龈下菌斑DNA浓度治疗前后变化不明显,无统计学意义, ·3·表明治疗后龈下菌群量无明显变化。DGGE胶的龈下菌群DNA图谱显示,治疗后龈下细菌种类和比例发生改变,即龈下菌群构成比发生变化。 4.测序结果进一步证实 Pg是成人牙周炎重要可疑致病菌,治疗前大量的存在于龈下菌斑,治疗后分布减少,甚至检测不到。 5.DGGE成功地得到龈下菌群DNA图谱,可以动态观察龈下菌群组成变化?