光谱及分子对接技术研究小分子药物与DNA、蛋白的相互作用

来源 :长春师范大学 | 被引量 : 9次 | 上传用户:LIUANQING5201314
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本文主要采用光谱法和分子对接法研究了几种小分子药物与血清白蛋白和DNA的相互作用,主要研究内容如下:在pH=7.40的条件下,采用多种光谱技术研究了隐丹参酮与人血清白蛋白(HSA)的相互作用。隐丹参酮对HSA的猝灭过程为静态猝灭,并获得了在不同温度下隐丹参酮与HSA作用的结合常数和结合位点数。热力学参数研究发现隐丹参酮与HSA的主要结合力为静电作用力。位点竞争实验结果表明隐丹参酮结合在HSA的site I位。同步荧光光谱法和圆二色光谱法的结果表明隐丹参酮的加入使HSA的二级结构发生变化。考察了金属离子对隐丹参酮-HSA体系的影响。根据F?rster理论,计算得到隐丹参酮与HSA之间的结合距离r0为2.86 nm。利用光谱法和分子对接法研究了昔萘酸沙美特罗与牛血清白蛋白(BSA)的相互作用。紫外光谱法表明BSA的加入对昔萘酸沙美特罗的紫外吸收光谱产生影响。荧光猝灭和时间分辨荧光光谱法的结果表明昔萘酸沙美特罗对BSA的猝灭过程为静态猝灭。得到了不同温度下的结合常数和结合位点数,结合作用力为静电作用。位点竞争实验和分子对接法的结果显示昔萘酸沙美特罗结合在BSA的site I位。红外光谱法、同步荧光光谱法和圆二色光谱法的结果表明昔萘酸沙美特罗的加入对BSA的二级结构产生影响。此外,还探究了K+、Ca2+、Cu2+、Zn2+和Fe3+对昔萘酸沙美特罗-BSA体系的影响。计算得到昔萘酸沙美特罗与BSA之间的结合距离为2.37 nm。采用光谱法、粘度法、电化学法和分子对接法研究氢溴酸右美沙芬与DNA的相互作用。荧光猝灭和时间分辨荧光光谱法的结果表明二者的猝灭过程为静态猝灭。获得了291、301和311 K下的结合常数和结合位点数,热力学参数的结果表明氢溴酸右美沙芬与DNA以范德华力或氢键相结合,结合距离为2.54 nm。红外光谱法和圆二色光谱法的结果表明氢溴酸右美沙芬的加入对DNA的二级结构产生了影响。紫外吸收光谱法、离子强度实验、粘度法、熔解温度实验和与单链DNA(ssDNA)作用的结果均表明氢溴酸右美沙芬与DNA的结合是嵌插作用。分子对接的结果表明二者以嵌插模式相结合,在结合的过程中,氢键发挥了重要作用。循环伏安法和微分脉冲伏安法的结果显示DNA的加入使氢溴酸右美沙芬的峰电位发生了移动。以吖啶橙(AO)为探针研究了硫酸新霉素和硫酸巴龙霉素与DNA的相互作用。荧光猝灭法和时间分辨荧光光谱法的结果表明硫酸新霉素/硫酸巴龙霉素与AO-DNA的作用是静态猝灭过程。在291 K时,硫酸新霉素和硫酸巴龙霉素与AO-DNA的结合常数分别为6.70×103和1.44×103 L·mol-1。ΔH、ΔS和ΔG的结果表明硫酸新霉素/硫酸巴龙霉素与AO-DNA以范德华力和氢键发生结合。红外光谱法和圆二色光谱法的结果表明硫酸新霉素/硫酸巴龙霉素的加入对DNA的二级结构产生了影响。离子强度实验、粘度法、熔解温度实验和与ssDNA作用的实验结果均证明硫酸新霉素/硫酸巴龙霉素与DNA以沟区模式相结合。分子对接法进一步表明硫酸新霉素/硫酸巴龙霉素结合在DNA小沟区的A-T富裕区。采用光谱法、粘度法和分子对接法研究了以溴化乙锭(EB)为荧光探针小诺霉素/妥布霉素与DNA的相互作用。荧光猝灭法和时间分辨荧光光谱法的结果表明小诺霉素/妥布霉素与EB-DNA的作用是静态猝灭过程。得到了不同温度下小诺霉素/妥布霉素与EB-DNA的结合常数和结合位点数,ΔH、ΔS和ΔG的结果表明小诺霉素/妥布霉素与EB-DNA以范德华力和氢键发生结合。红外光谱法和圆二色光谱法表明小诺霉素/妥布霉素的加入对DNA的二级结构产生了影响。离子强度实验、粘度法、熔解温度实验和单双链DNA对比实验的结果均表明小诺霉素/妥布霉素与DNA的作用模式为沟区结合。分子对接法表明小诺霉素/妥布霉素与DNA以沟区模式相结合,在结合过程中氢键发挥了重要作用。
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