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伯乐树(Bretschneider a sinensi Hemsl.)又名钟萼术,是我国特有的、古老的单种科植物,作为第三纪古热带植物区系的孑遗种,对研究被子植物系统发育及古地理、古气候等方面具有重要的科学价值。目前,们乐树已处于濒危状态,被列为国家一级保护植物。本文以伯乐树为研究对象,采用简单重复间隔序列(inter-simple sequence repeats, ISSR)标记分析比较了伯乐树15个天然种群以及部分天然种群与人工种群间的遗传多样性差异,旨在为制定伯乐树遗传资源保护策略提供理论依据。主要研究结果如下：根据正交设计表L16(45)设计,建立了伯乐树ISSR-PCR最佳反应体系：20μL反应体系,Mg2+2.0mM, dNTPs0.25mM,引物0.40μM, DNA70ng, Tag酶1.75U,适宜的反应程序为：94℃预变性4min,94℃变性40S,退火40S(退火温度随引物而定),72℃延伸90S,40个循环,72℃总延伸7min,4℃保存。利用已优化的ISSR-PCR反应体系,从100条引物中筛选出稳定的、重复性高的7条引物(UBC824、UBC825、UBC834、UBC836、UBC843、UBC844、 UBC872)对伯乐树15个天然种群进行ISSR-PCR扩增,共扩增出86个位点,其中多态性条带64条,多态性条带百分率(PPB)为74.42%,各种群PPB值为18.60%-53.49%,平均为38.06%。种内Shannon表型多样性指数(HPOP)为0.3630,平均为0.2081,这表明伯乐树物种与种群均维持较高的遗传多样性。分子方差(analysis of molecular variance, AMOVA)分析显示,种群间与种群内遗传变异分别占总遗传变异的29.73%和70.27%。种群间遗传分化系(Φst)数为0.2973。UPGMA (unweighted pair-group method with arithmetic-means)聚类法可将15个天然种群分为4组,黎平(LP)独立为一组群,阳明山(YMS)、莽山(MS)、南昆山(NKS)和九连山(JLS)种群聚为一组群,乳阳(RY)、田心(TX)、大东山(DDS)、井冈山(JGS)、八面山(BMS)、大瑶山(DY)、猫儿山(MRS)、花坪(HP)种群聚为一组群,黄桑(HS)、舜皇山(SHS)种群聚为一组群。对南岭山地伯乐树2个人工种群和4个天然种群的遗传多样性分析比较显示,天然种群PPB和HPOP分别为70.93%和0.3882,高于人工种群(PPB=53.49%,HPOp=0.2941); AMOVA分析表明,天然种群的遗传分化(ΦST=0.3407)明显高于人工种群(ΦST=0.2248)。研究结果认为,已建立的迁地保护种群不能有效地保护南岭地区天然种群的遗传完整性。基于本研究研究结果,我们初步认为,应优先保护湖南阳明山(YMS)、莽山(MS)等遗传多样性高的种群；并从多个种群中采集种子,在适宜伯乐树生长的小气候环境中建立人工迁地保护种群,增加人工迁地保护遗传变异水平,缓解伯乐树种群因自身原因及人为破坏等原因形成的生存威胁,避免遗传多样性丢失。