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目的:深龋是一种常见的龋病类型,因其龋坏程度深,致龋菌可侵入牙本质深层,易引起龋源性牙髓炎。本研究利用宏基因组学高通量测序的研究方法,分析年轻恒磨牙深龋中微生物的物种组成和功能特征,并对年轻恒磨牙深龋不同深度层次来源样本中微生物的差异进行了比较。材料和方法:收集年轻恒磨牙深龋浅层和深层样本,提取DNA后建库,利用Illumina平台高通量测序技术测序,采用Meta Gen Mark软件进行基因预测,使用DIAMOND软件于Micro NR数据库和KEGG数据库分别进行物种注释和功能注释,多种统计学方法分析比较年轻恒磨牙深龋微生物的物种组成和功能特征。结果:1.本研究利用宏基因组高通量测序技术建立了部分年轻恒磨牙深龋微生物基因集。我们共获得64.1 Gb的测序有效数据,每个年轻恒磨牙深龋样本的平均测序数据量为6.41Gb,经序列组装,基因预测后得到514,496个非冗余基因。2.在年轻恒磨牙深龋样本中,共检测到85门,92纲,137目,274科,981属,3869种细菌。3.在年轻恒磨牙深龋样本中,高丰度优势菌门依次是厚壁菌门(Frmicutes,39%)、放线菌门(Actinobacteria,33.9%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,9.2%)、变形菌门(Proteobacteria,4.1%)、梭杆菌门(Fusobacteria,3.7%)。这五种优势菌门在10个年轻恒磨牙深龋样本中均能高丰度检出,并且含量占到了整体的90%以上,是年轻恒磨牙深龋的主体结构菌群。4.年轻恒磨牙深龋样本中物种丰度top10的优势菌属依次是乳杆菌属(Lacto bacillus,23.1%)、丙酸杆菌属(Propionibacterium,11.5%)、奥尔森菌属(Olsenella,10.4%)、放线菌属(Actinomyces,7.0%)、链球菌属(Streptoc occus,6.4%)、普氏菌属(Prevotella,4.7%)、月形单胞菌属(Selenomonas,2.0%)、帕拉斯卡拉多菌属(Parascardovia,1.8%)、纤毛菌属(Leptotrichi a,1.6%)、韦荣球菌属(Veillonella,1.7%)。5.年轻恒磨牙深龋样本中物种丰度top10的优势菌种依次是酸性丙酸杆菌(P ropionibacterium acidifaciens,11.3%)、变形链球菌(Streptococcus mut ans,4.7%)、加氏乳酸杆菌(Lactobacillus gasseri,5.2%)、普罗萨奥尔森菌(Olsenella profuse,4.3%)、阴道乳酸杆菌(Lactobacillus vaginal is,2.1%)、酵母乳杆菌(Lactobacillus oris,2.0%)、帕拉斯卡拉多齿菌(Parascardovia denticolens,1.8%)、伞形目奥尔森菌(Olsenella umbona te,1.6%)、隐性乳酸杆菌(Lactobacillus ultunensis,1.5%)、唾液乳酸杆菌(Lactobacillus salivarius,1.1%)。6.年轻恒磨牙深龋深层与浅层的微生物物种多样性在门,属,种水平上比较,组间均无显著性差异(P>0.05)。7.在本次研究获得基因集与KEGG数据库注释比对结果中,年轻恒磨牙深龋浅层和深层微生物在功能基因层面上,无显著性差异,且碳水化合物代谢和氨基酸代谢有关的功能基因在年轻恒磨牙深龋微生物功能基因集中比例最高,分别占到5.75%和5.41%。结论:1.宏基因组学高通量测序技术能有效分析年轻恒磨牙深龋口腔微生态丰富的物种多样性和功能特征。2.年轻恒磨牙深龋浅层和深层微生物在物种组成和功能基因层面上,不存在显著性差异。3.年轻恒磨牙深龋中口腔微生物的功能基因表达首要分布在碳水化合物代谢和氨基酸代谢通路上。