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鉴定、克隆及功能解析水稻生长发育相关基因,有目的地累加、搭配不同来源、功能的有利等位变异,是培育高产、优质、多抗／耐新品种的基础。稻属其它物种虽然产量和品质性状远低于现代亚洲栽培稻品种,但其中存在栽培稻中不具有的优良基因资源。非洲栽培稻在非洲有3500年的种植历史,虽产量潜力不高,但在抗性等方面具有许多优异基因。由于其与亚洲栽培稻存在严重的生殖隔离,难于构建遗传分析群体,故对非洲栽培稻基因发掘的研究较少。S1是一个非洲栽培稻与亚洲栽培稻的种间杂种不育位点,位于第6染色体短臂的末端。本研究以180份非洲栽培稻为供体亲本,以云南高原粳稻品种滇粳优1号、合系39号为受体亲本,分别构建了一批高代回交群体,以来源于31个供体的35个BC7F1群体进行分析,其中,15个群体中发现S1的存在,以这15个BC7F1回交群体,以及1个由569个单株构成的BC3F2群体对S1进行遗传分析结果表明：1)S1是亚洲栽培稻与非洲栽培稻间普遍存在的杂种不育位点；2)S1同时作用于雌雄配子,花粉败育类型为典败及圆败;3)对BC3F2群体调查表明,除雌配子外,S1对雄配子的灭杀作用也不完全,有26.33%的S1a雌配子以及9.06%的S1a雄配子能够传递到后代中；4)S1与位于第1、4染色体上的两个位点具有互作,这2个位点能够抑制S1的表达；5)S1的败育机制较为复杂：BC6F1杂合株产生的雌配子中,不仅是大量的S1a雌配子,还有部分的S1g雌配子不能传递到下一代,这一结果说明了该位点所控制的杂种不育的复杂性,它不能简单地以“单位点孢子体-配子体互作模式”来解释。以180个非洲栽培稻为初始供体亲本,构建了一批回交高代材料。用其中的1个BC3F2、2个BC3F5、26个BC7F1回交群体对来自非洲栽培稻农艺性状相关的有利等位变异进行发掘、鉴定。共发现26个来自非洲栽培稻的农艺及形态性状相关的等位变异。包括8个每穗粒数、2个粒长、1个粒宽、2个粒重、6个株高、2个芒的有/无、1个顶芒长度、3个散穗、1个直立密穗。来自非洲栽培稻亲本的增效等位变异16个,对改良亚洲栽培稻产量性状的有利等位变异10个,其中,4个增加穗粒数的等位变异：qnp1-1、qnp7-1、qnp10-1和qnp10-2；1个增加粒宽的等位变异,为qgwd6-1;1个增加粒重的等位变异,为qgw6-1；3个降低株高的等位变异,为qph6-1,qph6.3, qph10-1；1个直立穗密穗等位变异,即DEP4。通过这一研究,说明及证实了虽然非洲栽培稻在产量潜力上不及亚洲栽培稻现代品种,但非洲栽培稻遗传资源中仍然存在着的可供亚洲栽培稻育种改良的有利等位变异,应进一步加强非洲栽培稻遗传资源的发掘利用。