随着我国经济步入“新常态”,经济发展从要素、投资驱动逐渐转向创新驱动,提升科技创新能力已然成为我国经济高质量发展的关键。自“创新驱动发展战略”实施以来,我国全社会研发经费投入水平大幅度提升,研发经费总量目前位居世界第二。企业是创新的主体,近年来,随着企业自筹研发资金和政府研发补助投入力度的不断增加,企业在我国研发经费投入中长期占据着主导地位。基于以上背景,本文针对研发经费的高投入如何为企业的创新发展提供了强有力的支持这一重要问题,按资金来源将企业研发经费划分为企业自筹研发资金和政府研发补助,基于专利视角着重探究企业自筹研发资金、政府研发补助与企业财务绩效的影响机制。高新技术制造业具有技术要素密集、低资源消耗、高产品附加值等特征,是实施创新驱动发展战略的重要载体,其自筹研发资金投入水平和政府研发补助资助水平相对较高。因此,本文以A股高新技术制造业上市公司为研究对象。本文首先对研发经费、专利产出的概念进行界定,并对研发经费、专利产出、财务绩效相互关系的研究现状进行梳理。其次,在文献述评的基础上结合创新理论、内生增长理论、资源基础理论对研发经费、专利产出、财务绩效两两之间的相关关系以及专利产出在研发经费影响财务绩效过程中的中介效应提出研究假设,再次,以A股572家高新技术制造业上市公司2009-2017年非平衡面板数据为研究样本,综合运用描述性统计分析、Pearson相关性分析、固定效应模型回归分析,进行假设验证。并进一步将全样本企业按产权性质划分为国有企业和非国有企业进行分样本实证比较。研究表明:（1）高新技术制造企业研发经费与财务绩效呈显著正向相关关系。（2）高新技术制造企业研发经费与专利产出呈显著正向相关关系。（3）高新技术制造企业专利产出与财务绩效呈显著正向相关关系。（4）高新技术制造企业专利产出在研发经费影响财务绩效的过程中呈现出部分中介效应。（5）在产权性质不同的高新技术制造企业中,研发经费与专利产出的相关关系以及研发经费与财务绩效的影响机制存在差异。（以上结论中的企业研发经费均按资金来源划分为企业自筹研发资金和政府研发补助）最后,总结研究结论,深入分析原因,并从政府层面和企业层面提出相应建议。