坦布苏病毒NS5蛋白核定位信号的鉴定与作用机制研究

来源 :山东农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xunzhaogancao
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
2010年4月,坦布苏病毒病在我国东南沿海地区(浙江、福建等地)爆发,之后迅速在我国养鸭场蔓延流行,感染后可引起产蛋鸭产蛋下降和雏鸭的神经症状,给我国养鸭业造成巨大经济损失。该病病原为坦布苏病毒(Tembusu virus,TMUV),是黄病毒属成员之一。同属黄病毒有乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)、西尼罗河病毒(West Nile Virus,WNV)、登革病毒(Dengue virus,DENV)和寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)等。研究表明,多种黄病毒的NS5蛋白可以拮抗JAK-STAT信号转导来对抗宿主IFN-Ⅰ反应,以此逃避天然免疫反应。本实验室前期研究表明,TMUV-NS5利用37~45 aa与核转运蛋白(KPNA1)互作,拮抗JAK-STAT信号转导,同时核定位信号(NLS)在病毒复制、病毒蛋白功能的发挥等方面具有关键作用。在此基础上,本研究对TMUV-NS5的NLS37~45进行筛选鉴定,同时对其相关功能和作用机制进行深入探究,研究内容包括以下几个方面:1.TMUV-NS5-NLS37~45鉴定及TMUV-NS5亚细胞定位分析实验室前期研究证实TMUV-NS5-NLS37~45具有核定位功能,并且可与KPNA1互作拮抗JAK-STAT。为进一步验证该序列的生物学活性,本研究构建NLS与2×GFP的串联表达质粒,IFA结果显示NLS37~45可以携带2×GFP进入细胞核,Co-IP也显示NLS37~45-2×GFP与KPNA1存在相互作用,从而证实了NLS37~45的生物学活性。此外,本研究将NLS37~45连接到TMUV-NS5-Rd Rp结构域,细胞定位结果显示NLS37~45可以将原本定位在细胞质中的Rd Rp结构域带入细胞核,进一步说明了前期结果的准确性。同时根据氨基酸相似性分析,TMUV-NS5的37~45位氨基酸在TMUV中高度保守。NLS中的碱性氨基酸对其发挥活性至关重要。为确定37~45 aa中发挥功能的碱性氨基酸,本研究将NLS37~45中的碱性氨基酸进行单点突变,构建包含NLS37~45与2个GFP蛋白的一系列突变体表达质粒。IFA结果显示,除野生型NLS37~45-2×GFP可以完全定位在细胞核,其它突变体均呈现出非完全核定位。为验证上述结果的准确性,将突变体质粒与Myc-KPNA1共转染HEK293细胞,Co-IP显示,与NLS37~45-2×GFP共转组相比,其它突变体与KPNA1的互作能力均明显减弱。以上结果证实,TMUV-NS5-NLS37~45中每个碱性氨基酸均发挥功能性作用。在确定NLS37~45具有生物活性后,为确定其能否将TMUV-NS5定位在细胞核,本研究进行了后续鉴定。本研究在Hela细胞中过表达HA-NS5,对TMUV-NS5蛋白的亚细胞定位进行分析,激光共聚焦结果显示TMUV-NS5定位在细胞质中,并且不受IFN-α刺激时间的影响;出核抑制剂LMB的使用也未将NS5蛋白集中在细胞核,该结果充分说明TMUV-NS5蛋白的亚细胞定位是在细胞质中。尽管本研究确定了NLS37~45的核定位活性,却未发现TMUV-NS5的细胞核定位,推测蛋白的细胞核定位与多种因素密切相关。2.NLS37~45核定位能力分析本研究分别构建能够串联表达NLS37~45与2、3、4个GFP蛋白的表达质粒(NLS37~45-2×GFP、NLS37~45-3×GFP、NLS37~45-4×GFP),以模拟不同分子量的货物蛋白。转染Hela细胞并结合激光共聚焦分析其细胞定位,结果显示当蛋白质分子量较小时,NLS37~45可以携带蛋白质(2×GFP、3×GFP)入核,呈现出完全核定位;当分子量增加到一定大小时(4×GFP),则不能完全核定位,呈现出弥散分布。该结果说明NLS37~45的核定位能力与货物蛋白的分子量大小有关。为进一步验证上述结果,本研究对NS5蛋白进行相应截短,并鉴定各截短体的细胞定位。结果显示包含NLS37~45的截短体可以核定位,而不含NLS37~45的区域则定位于细胞质中;并且NLS37~45-Rd Rp完全核定位,TMUV-NS5包含NLS37~45只定位在细胞质中。本研究将黄病毒属中已确定具有核定位各自NS5蛋白的NLS等位替换到TMUV-NS5蛋白中,并观察这种替换是否影响TMUV-NS5的细胞定位。结果显示,突变体TMUV-NS5仍定位在细胞质中,该现象说明不限于货物蛋白的分子质量,NLS37~45的定位能力还与蛋白分子结构有关,不同类型的货物蛋白同样影响NLS功能发挥。3.黄病毒属病毒NLS37~45同等区域比较分析经过以上分析,本研究证实TMUV-NS5-NLS37~45具有典型的NLS功能,为进一步分析黄病毒属成员此段区域是否具有相同功能,选取五种典型的黄病毒,对同等区域的氨基酸序列进行相似性分析。结果显示,NLS37~45序列相对比较保守,TMUV与WNV、JEV仅有1个碱性氨基酸种类的差别,ZIKV、YFV和DENV-2与TMUV-NS5-NLS37~45相似性较低。随后,本研究将全部序列与2×GFP连接,分析不同黄病毒37~45 aa(或38~46 aa)区域是否同TMUV-NS5-NLS37~45一样具有核定位活性。激光共聚焦结果显示,其它黄病毒的该区域并不能将2×GFP完全定位于细胞核中,从而说明NLS37~45在TMUV中具有活性的特异性。将黄病毒同等区域中相应位置的碱性氨基酸突变为与TMUV-NS5-NLS37~45相同的碱性氨基酸结构,转染后,细胞定位结果显示,突变后的序列可携带2×GFP完全定位在细胞核中,说明该序列在突变后具备了核定位能力。此外,Co-IP结果也显示突变后的序列与KPNA1发生相互作用。这提示若其它黄病毒发生上述突变,可能使它们的NS5蛋白对JAK-STAT信号通路抑制作用增强,进一步拮抗天然免疫反应。综上,本研究成功鉴定TMUV-NS5的核定位信号(NLS37~45),并对其核定位能力进行探究,明确了TMUV-NS5-NLS37~45的核定位能力与货物蛋白的分子量大小和结构密切相关,同时揭示其它黄病毒若发生此类突变的风险性。
其他文献
氧化应激会对畜牧业规模化养殖产生重大的影响,也是养猪业发展的一大阻碍,并且与生猪的生长发育及机体功能等密切相关。大蒲莲猪是优良的山东省地方猪种资源,与国外引进猪种相比其具有繁殖力强、抗逆性高以及耐粗饲等优良特质,但在育肥性能、饲料利用率以及生长发育等方面与国外引进猪种相比却存在显著差异。本试验基于课题组前期研究发现,利用SLAF-seq(特异长度扩增片段测序)简化基因组测序分析大蒲莲猪与国外引进猪
学位
鸡的卵泡选择是指从一组直径为6~8mm的小黄卵泡(Small yellow follicle,SY)中选出一个进入等级卵泡的过程,受卵泡选择后的卵泡快速发育、排卵并产蛋。卵泡选择是影响鸡产蛋性能的关键因素。据估计,性成熟的母鸡约有12,000个卵母细胞,但其中只有几百个(4%)经卵泡选择发育成熟和排卵。课题组前期发现组蛋白赖氨酸特异性去甲基化酶1(Lysine(K)-specific demeth
学位
生物多样性倍受全球各界关注,土壤生物多样性是其中研究热点之一。农田生态系统的生态安全与人类密切相关。我国耕地面积广阔,尤其是东部农区,既是主要粮食产区,也是重要的农业生态集中地。土壤革螨是常见三大土壤动物类群之一,分布广泛,数量庞大,但由于诸多因素使得革螨研究滞后于其他土壤动物。本研究以农区土壤革螨为研究对象,在南方五省农区中选择三种不同生境(农田、人工林、其他生境)的土地,采集土壤革螨标本,通过
学位
氨是一种重要的大气污染物,会对人和畜禽的健康产生不良影响。本研究旨在研究温度和含水率对鸡粪氨气产生的影响及粪便排出后不同时间氨气的产生规律以及菌群组成的差异与机制,并探讨了日粮组成对氨气产生的影响,为生产中合理控制和改善舍内空气环境质量提供支撑。试验一不同温度和含水率下粪便氨气的产生规律。分别收集36周龄蛋鸡新鲜粪便,温度处理设3个组(25°C,29°C与33°C),含水率处理设3个组(添加0%、
学位
TRP(Transient receptor potential,瞬时感受器电位)离子通道与Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)对细菌内毒素尤其是LPS(Lipopolysaccharide,脂多糖)具有双重识别作用,被视作先天免疫系统的重要组成部分。解析TRP离子通道与TLR-4信号转导通路的联系有助于揭示宿主固有防御机制,鉴于肠道免疫对家禽健康的重要性,本课题研究
学位
近年来,H9N2亚型低致病性禽流感成为我国家禽中流行范围最广泛的亚型之一,感染家禽通常不发病,主要表现为生产性能降低,但当与H5、H7或其他病原体(如大肠杆菌、传染性支气管炎)混合感染时,会明显增加家禽的发病率和死亡率,严重阻碍了我国养禽业的健康发展。饲用益生菌具备绿色,安全,无污染等优点,现已成为畜禽养殖业理想的抗生素替代品。重组乳酸菌活疫苗因其可直接口服,给药方便,安全无毒等特点得到了广泛研究
学位
玉米赤霉烯酮(Zearalenone,ZEA)是一种具有雌激素作用的非甾体类镰刀菌真菌毒素。ZEA及其代谢产物主要会污染玉米、大麦、小麦和高粱等谷物。ZEA的雌激素作用会干扰牲畜的雌激素水平,影响动物的繁殖能力,尤其对猪的影响巨大。因食入ZEA,造成母猪的流产、死胎和畸形,对农业生产造成的损失巨大。第一部分:ZEA通过AMPK/mTOR通路介导的自噬诱导猪子宫肥大。选择断奶的三元(杜洛克×长白×大
学位
家禽卵巢卵泡的发育是影响产蛋性能的关键因素。Wnt/β-catenin信号通路能够调节卵巢卵泡发育,CTNNB1基因编码的β-Catenin蛋白是该信号通路中的核心成分。本课题组前期研究发现同日龄已开产母鸡卵巢中的CTNNB1含量显著高于未开产母鸡,且CTNNB1基因在等级卵泡颗粒细胞中的表达量显著高于膜细胞。本试验旨在探究CTNNB1基因的功能及其作用机制,通过干扰和过表达CTNNB1基因,来探
学位
肉兔是节粮型草食动物,生产效益高。兔肉富含蛋白质、矿物质,脂肪、胆固醇含量低,被誉为“美容肉”、“益智肉”,受到人们青睐。我国是世界第一养兔大国,肉兔良种选育是其产业发展的基石。在过去十几年间,常规育种方式在肉兔选育中已取得显著成效,然而常规育种方式具有成本高、效率低等不足,影响肉兔选育。近年来,基因组选择(Genomic selection,GS)因其可以弥补常规育种方式的不足,在家畜遗传改良中
学位
水貂出血性肺炎是严重危害水貂养殖业健康发展的重要疫病之一。在过去很长一段时间,人们曾认为该病是由铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,P.aeruginosa)感染引起的。但近十年来研究表明,P.aeruginosa单一感染对水貂的致病力并不强,不能引发水貂出血性肺炎,该病应该还有其他的诱因。H9N2亚型流感病毒(Influenza A virus,IAV)在水貂群中广泛流行
学位