水是一切生物赖以生存的物质基础，是人类发展不可缺少的自然资源。随着经济社会的不断发展，人类对水资源的需求不断增长，开发力度不断加大，同时面临的水资源保护与利用问题也不断增多。　　 三峡库区核心区是我国水资源环境的敏感区、脆弱区和易污染破坏区。三峡工程建成后，发挥了巨大的防洪、发电、通航等综合效益，库区核心区经济社会也发生巨大的变化，总体发展水平得到了较大提高，但同时也给库区核心区生态环境带来了巨大压力，直接影响着三峡库区水环境和生态安全。加强库区核心区水资源保护与利用，对于全面贯彻落实以人为本、科学发展观和构建和谐社会理念，统筹人与自然和谐发展，缓解三峡库区的资源环境紧张矛盾，保持良好的水陆生态环境，保护人民群众健康，保障三峡水库水质安全和中国淡水资源战略储备库安全等都有着重大现实意义和深远历史意义。　　 论文从三峡库区核心区水资源保护与利用面临的问题入手，立足于三峡库区核心区，认真分析了区域发展现状及存在问题、经济发展和水资源保护与利用关系等，并对新形势下三峡库区核心区经济发展与水资源保护的协调路径、水资源保护与利用管理体制机制、水资源保护与利用措施进行了深入研究，结合国内外水资源保护、水污染防治的生态观念和思路，对三峡库区核心区农村生活污水处理、生活垃圾处理、农村面源污染防治、次级河流污染防治、船舶污染防治措施进行了初步探讨，通过对水资源保护系列可持续污染防治技术筛选，为改善三峡库区生态环境提出科学适用的建议，确保水资源可持续利用，充分发挥三峡工程的综合效益，给库区和中下游人民造福。　　 ①通过对库区经济发展现状、水资源保护与利用存在的问题以及经济发展和水资源保护与利用的关系进行分析研究，提出了三峡库区核心区经济发展和水资源保护与利用“长、短”期结合、分步协调的战略路径。　　 ②通过对库区现行的水资源保护与利用体制机制研究，对水资源保护与利用管理体制存在的问题进行了分析，并结合库区实际情况，提出了行政管理和市场运作相结合的全新模式，即在发改委下设水资源统一管理协调委员会，实行水资源统一管理；组建国有独资或国有控股的水务集团，建立竞争性特许经营机制，实现水务资产一体化的体制建议，以及强化组织机构建设、加强法规和标准化体系建设、完善生态环境评价标准、加大资金投入、建立生态补偿、实施人口减载以及加强宣传教育等方面的机制建议。　　 ③根据对三峡库区核心区水资源保护主要污染来源的现状分析，确定了水资源保护措施的研究方向，重点对三峡库区核心区农村生活污水处理、生活垃圾处理、农村面源污染防治、次级河流污染防治、船舶污染防治五个方面进行了分析研究，提出了适应三峡库区经济社会可持续发展的污染防治措施与规范。