新疆地区维吾尔族和汉族高度近视家系的研究

来源 :新疆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:houjhz
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目的:分析新疆地区维吾尔族与汉族高度近视(High Myopia,HM)家系的致病基因,比较其是否存在差异。方法:1例新疆地区维吾尔族家系和1例新疆地区汉族家系参加了本研究,对所有可获取家庭成员均进行了详细的眼科检查,进行了外周静脉血标本的采集,并提取基因组DNA。选取汉族家系4例病例组和3例对照组及维吾尔族家系4例病例组和2例对照组的DNA标本,进行全外显子组测序(Whole Exome Sequencing,WES),对测序结果进行筛选,将携带有害变异位点的突变基因作为候选基因,通过显著性富集分析方法,探讨突变基因参与的最主要生化代谢和信号传递途径。结果:从汉族家系的WES检测分析中得到了162,836个SNV和29,225个In Del,通过进一步的筛选,预测COL14A1、GDF6、MMP28、TIAM1可能与该家系发生HM有一定的关系;从维吾尔族家系的WES检测分析中得到了162,412个SNV和12,790个In Del,进一步筛选出CCDC191、PPEF2、JMJD1C、MGAT2、TTLL5、NRDE2、NETO1、EYA2、SPECC1L、SREBF2、PPP6R2、TBRG4、KRT10、OR13C8、MAPK8IP2,认为这19个基因是该家系导致HM的突变基因可能性大。截至目前为止,这可能是在新疆地区维吾尔族近视人群中发现的首例高度近视相关基因变异位点。结论:最终检测出的突变基因中,未发现与先前报道的有关HM基因重合基因、未发现两家系重合基因,这也表明了HM的遗传异质性和种族差异性;查阅文献,发现上述19个突变基因在体内的异常表达,使细胞组织失去正常结构,从而引起一系列疾病的发生及发展,这些基因与眼睛大小的发育、胶原蛋白的形成、晶状体的混浊、眼外肌发育及视网膜病变的发生等有关,尤其是巩膜细胞外基质重塑与病理学近视有密切相关性,巩膜在控制眼球形态和近视眼发展中可能起着关键作用。需要后期进一步行Sanger测序及生物信息学分析评估这些突变基因对HM患者的致病性。
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