植绥螨系统关系及巴氏新小绥螨不同群体分析

来源 :南昌大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xphant888
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本论文基于ITS基因序列对植绥螨科17种植绥螨类群的系统发育关系进行了探讨,并使用ISSR分子标记对巴氏新小绥螨的居群遗传多样性进行评估,分析和探讨了其居群遗传结构和种群差异。主要研究内容和结果有以下两个方面:   1、植绥螨的分子系统发育分析   本文通过对17种植绥螨ITS基因序列(包括实验所测得四种植绥螨ITS基因序列及从Genbank中所获得的13种植绥螨ITS序列)的比对分析,探讨其属间,种间的系统发育关系。   实验所测四种植绥螨ITS片段A+T平均含量为57.63%,、G+C平均含量42.38%。在ITS1,5.8S与ITS2三个区段中,ITS1区段含有变异位点117个,简约信息位点20个。ITS2区段包含变异位点16个,简约信息位点2个。5.8S区段的变异位点和简约信息位点则较少分别为8个和1个。17种植绥螨的ITS片段A+T平均含量为57.5%,G+C平均含量为42.5%。ITS1区段含有变异位点214个,简约信息位点137个。ITS2区段则包含变异位点44个,简约信息位点12个。相对于这两个区段5.8S区段的变异位点和简约信息位点则较少分别为19个和4个。碱基的插入/缺失主要集中在ITS1区段,ITS2与5.8S区段的序列插入/缺失相对较少。三个区段中5.8S区段表现出很高的保守性。在17植绥螨中,碱基转换/颠换最多的是M.occidentalis,碱基插入/缺失则是T.pyri最多。   通过ITS分子系统树显示,小新绥螨属和小植绥螨属亲缘关系较近,伊绥螨属则与真绥螨属亲缘关系较近。MP与NJ树都显示,静走螨属独立为一支,与其它各属亲缘关系较远。分子系统树显示,钝绥螨属的草栖钝绥螨划入真绥螨较多的一支,钝绥螨属的津川钝绥螨和A.alpinus划入新小绥螨较多一支。基于ITS基因序列构建的分子树显示该7属间关系为:{[(小新绥螨属+部分钝绥螨属)+小植绥螨属]+[(真绥螨属+部分钝绥螨属)+伊绥螨属)]+盲走螨属}+静走螨属。   本文中所探讨的17种植绥螨为同一科不同属,利用ITS基因序列能较好地构建其分子系统树,了解其亲缘关系,这也说明ITS基因能较好地解决植绥螨属内种间低级阶元的系统发育关系。   2、巴氏新小绥螨居群遗传多样性分析   (1)ISSR-PCR反应体系优化:通过正交实验方法,建立了ISSR-PCR最佳扩增体系Taq DNA聚合酶0.20μL,MgCl21.5μL,dNTPs0.625μL,Primer0.25μL,10×PCR Buffer2.5μL,模板DNA4μL,ddH2O15.925μL,总体积25μL。   (2)ISSR-PCR扩增结果:实验共筛选出13条引物,分别对赣州三个居群进行ISSR-PCR扩增,产生52条带,其中22条为多态性条带,多态性条带百分比(PPB)达到42.31%。   (3)遗传多样性分析:多态性条带百分比PPB、Shannon多样性指数Ⅰ及期望杂合度He对居群遗传多样的评价结果相一致:安远居群的遗传多样性高于大余与信丰,大余与信丰两地的居群则遗传多样性差异不显著;   (4)居群遗传结构和基因流:居群间的遗传分化系数Gst=0.6810,说明大部分的遗传多样性分布在居群内。Nei’s无偏遗传距离UPMGA聚类分析显示3个居群的关系可表示为大余和信丰两个居群几乎无差异,而安远则与上述两个居群的亲缘关系相对较远,但差异不大。
其他文献
目的:MAP30是一种核糖体失活蛋白,它能诱导多种细胞凋亡,但其凋亡机制尚未十分清楚。本文通过克隆苦瓜蛋白MAP30基因,原核表达并纯化MAP30融合蛋白;体外实验探讨MAP30诱导人胃癌细
报告29例(53次)缓慢心律失常的老年人(≥60岁)经静脉埋藏永久起搏器的结果,就埋藏永久起搏器患者缓慢心律失常类型,病因,适应证,随访等方面进行分析,并着重了解老年患者某些
本文以麻黄、云芝为研究对象,考察了超微粉碎、汽爆及酶解三种植物细胞破壁方法,将破壁与提取结合,强化植物中有效成分的提取过程,并进一步优化了破壁后的提取工艺。 1.通过气
本文对我国气体膜分离技术的发展历史和现状以及国外气体膜技术应用情况进行了概述性介绍,对我国气体膜分离技术的发展进行了展望。对膜材料、制膜工艺、膜技术的发展特点以及
会议
近十年来,我国汽车工业得到了迅猛发展,汽车保有量持续增加,汽车尾气的排放成为城市环境污染的主要来源,对城市居民的健康和生活造成很大的危害,尤其危害儿童的健康。 汽油清净
会议
本工作用微型催化反应评价装置结合多种物理化学手段如X-射线粉末衍射(XRD)、比表面积测试(BET)、激光拉曼光谱(LRS)、CO吸附、H2程序升温还原(H2-TPR)、NH3吸附-程序升温脱
交联聚合物溶液(LPS)是由低浓度部分水解聚丙烯酰胺(HPAM)和柠檬酸铝(AlCit)交联形成的,是交联聚合物线团(LPC)在水中的分散体系。LPS主要用于油藏的深部调剖,提高原油采收率。