差异显示RT-PCR及抑制性消减杂交法研究初治和复发急性白血病基因的差异表达

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目的 为探讨初治与复发急性白血病中基因的差异表达,筛选、克隆出人白血病复发相关基因,本文应用差异显示逆转录-聚合酶链式反应(Differential display reverse transcription polymerase chain reaction,DDRT-PCR)或/和抑制性消减杂交(Suppression subtractive hybridization,SSH)方法,从同一急性白血病患者的初治与复发时的骨髓样品中分离并鉴定出未知的急性白血病复发相关基因的表达序列标签(Expression sequence tags,EST),为进一步从这些未知基因的EST中获取全长的cDNA序列及进行相关的表达、功能分析打下基础,有助于探讨白血病复发的分子生物学机制。 方法收取了3对急性白血病患者的初治与复发时的骨髓标本,分离出单个核细胞,提取总RNA并纯化。用银染DDRT-PCR或/和SSH法从同一白血病患者的初治与复发时的骨髓样品中分离出EST,分离出的EST与T载体连接并转化入感受态细菌中,对质粒DNA进行测序,将差异表达EST部分核苷酸序列与GenBank核酸数据库中的已知序列进行同源性比较。根据分离出的未知基因EST序列设计引物,返回原样品中行RT-PCR扩增,消除假阳性。将110例急性白血病患者按病程分为初治组与复发组,用RT-PCR法检测部分获得的未知基因在这些患者的外周血或骨髓中表达水平,X~2检验统计分析结果。结果共获得22个新的差异表达的EST片段,其中8个登录GenBank,注册号(AeeeSSion No.)分别是:CB331913、CB412263、CB41226O、CB412262、C8412259、CB412265、CB412264和CB412261。并经RT一PCR方法初步证实其中一个EST(DD一86)在急性白血病复发患者中高表达,另一个EST(SSH一102)在急性白血病初治患者中高表达,显示可能与急性白血病的复发有一定相关性。 结论通过本文研究得出如下结论:1、应用DDRT一PCR和SSH法比较了初治与复发急性白血病基因的差异表达,获得了咒条新的EST片段,其中2条新的EST片段与急性白血病复发有一定相关性。2、SSH法较DDRT一PCR法优,具有简便易行,灵敏度高,重复性好,信息量大等优点,还克服了DDRT一PCR法的假阳性率高的缺点。3、为进一步探讨急性白血病复发的分子机制,筛选出较特异的复发相关基因,有必要对所获得的新的基因片段进行深入研究,包括其特异性鉴定、获取基因全长cDNA及功能分析。
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