塔里木河下游绿色走廊战略位置重要，生态环境问题突出。本研究在大量实地调查的基础上，结合塔里木河下游绿洲社会、经济、水文等资料，分析总结了塔里木河下游绿洲近50年来的水文变化和生态演变情况，指出，塔里木河下游水文劣变是生态退化的直接原因。　　 参考国内生态安全评价研究的方法，根据研究区的特点，选取单位面积耕地水资源拥有量、土地沙化率、农民人均纯收入和基本农田水利建设投入等21个指标构建了绿洲生态安全评价指标体系，采用专家打分法与层次分析法相结合的方法确定指标权重。通过构建计算模型，对塔里木河下游绿洲1981至2006间生态安全状况做出评价。评价结果显示：研究区内综合生态安全状况呈恶化发展趋势，2001年后综合生态安全状况开始转好，生态输水改善了当地的生态环境。目前，塔里木河下游绿洲生态安全综合评价得分5.82分，仍处于警戒状态，生态安全形势依然严峻。　　 从系统的观点和人文的视角出发，分析探讨了塔里木河下游生态退化的原因。指出，区域之间资源分配不均，区域社会经济发展水平低下和产业结构不合理导致水资源利用效益低下是塔里木河下游来水减少、生态退化的根本原因。分析论证了塔里木河下游生态治理的必要性和长期性，从可持续的观点出发，提出对流域进行生态区划和功能分区、加速流域城市化进程、设立塔里木河下游生态特区的生态治理思路和对策。