羊球虫病主要是由艾美耳球虫引起的,以腹泻、生长迟缓、饲料回报率下降为主要表现的一种寄生虫病,是危害羔羊健康的主要疾病之一。目前对球虫病的防控还是以化学药物为主,虽然对寄生虫病的防控药物目前还未禁用,寻求化药替代品用于球虫病的防控是肉羊健康养殖的需求。药食同源中草药可直接食用、健康、无残留、无耐药的优点为羊球虫病的治疗开辟了新思路。本研究采用药食同源中草药对羊球虫病进行治疗,通过球虫卵囊减少率、血清免疫指标、体重增长率以及对肠道菌群的影响评价治疗效果,以筛选效果良好的药食同源中草药,为肉羊产业绿色健康养殖提供参考。（1）6种绵羊肠道寄生虫感染情况调查及球虫种类鉴定为了解不同品种绵羊球虫的感染种类,采自内蒙古阿拉善、河南省周口市、河南省开封市、黑龙江省齐齐哈尔市4个地区,涵盖蒙古绵羊、杜寒杂交羊、澳洲奶绵羊、德克塞耳绵羊、兰德瑞斯绵羊、湖羊6个品种的羊粪便样品,采用水洗离心沉淀法、卢戈氏碘液染色法和饱和蔗糖溶液漂浮法对1011份羊粪便样品进行肠道寄生虫的显微镜检查,并根据虫卵或卵囊形态进行虫种鉴定。结果:本次调查寄生虫总感染率为94.56%（956/1011）,混合感染为26.41%（267/1011）。共检测到球虫、阿米巴原虫、线虫、绦虫、贾第虫和隐孢子虫6大类寄生虫,感染率分别为90.11%（911/1011）、43.92%（444/1011）,、22.45%（227/1011）、0.39%（4/1011）、5.14%（52/1011）和14.45%（142/1011）。4个地区共检测出绵羊球虫12种,而6个品种的绵羊都有的球虫种类有5种,分别是E.ahsata、E.ovinoidalis、E.crandallis、E.intricate、E.pallida。其中,蒙古绵羊发现9种艾美耳球虫,其中E.crandallis和E.granulose为优势虫种。杜寒杂交羊共发现12种艾美耳球虫,其中E.ovinoidalis为优势虫种。澳洲奶绵羊共发现7种艾美耳球虫,其中E.ovinoidalis、E.intricate为优势虫种。德克塞耳绵羊共发现7种艾美耳球虫,其中E.ovinoidalis为优势虫种。兰德瑞斯绵羊共发现5种艾美耳球虫,其中E.ahsata、E.pallida、E.ovinoidalis为优势虫种。湖羊共发现12种艾美耳球虫,其中E.ovinoidalis为优势虫种。结论:4个地区羊肠道寄生虫感染较为普遍,其中球虫感染率最高,为优势虫种。本调查为养殖场/户的羊群精准驱虫提供了参考依据。（2）5种药食同源中草药抗羊球虫效果评价的初步筛选为了解5种药食同源中药抗球虫效果,对自然感染球虫的28只断奶羔羊,随机分为7个组,每组4只。5个试验组分别饲喂鱼腥草、大蒜、马齿苋、牛至、洋葱,各中药组除牛至用量为10 g/只/d外,其他组都是30 g/只/d。连续用药7 d。另外2组分别用地克珠利和不用药对照（空白对照组）。根据用药前后球虫卵囊减少率、卵囊转阴率、日均增重量、相对增率、血液免疫指标及肠道菌群的影响来判定各用药组的药效和增重效益。结果,用药后7d,大蒜组和牛至组与对照组的卵囊减少率均高于对照组,差异极显著（P＜0.01）。用药后7、14、21d后,鱼腥草组和地克珠利的卵囊减少率均高于对照组,差异极显著（P＜0.01）。用药7、21 d各组断奶羔羊的日均增重量与相对增重率比空白对照组高,但差异不显著（P＞0.05）;用药组使用前后羔羊血清Ig G、IL-2、IFN-γ均无明显变化（P＞0.05）,表明试验药物对羔羊免疫力影响较小。通过对肠道菌群分析,鱼腥草、大蒜、洋葱能提高羔羊肠道菌群的物种丰富度和物种多样性。综合试验结果,挑选鱼腥草、大蒜、马齿苋三种药物进行后续试验。将45日龄断奶羔羊40只随机分为5组,鱼腥草、大蒜、马齿苋3个中药组和2个对照组。连续用药21天停药。在不同时间点检测球虫卵囊相对减少率、卵囊转阴率、增重量、及对肠道菌群的影响。结果:用药3周和停药1、2、8周鱼腥草、大蒜、马齿苋组卵囊相对减少率均高于空白对照组,差异显著（P＜0.05）,而地克珠利组与空白对照组相比差异极显著（P＜0.01）;用药3周和停药1、2、8周鱼腥草、大蒜、马齿苋组卵囊转阴率与空白对照组相比差异不显著（P＞0.05）,而地克珠利组与空白对照组相比差异极显著（P＜0.01）。用药3周和停药8周鱼腥草、马齿苋、地克珠利组日均增重量和相对增重率高于空白对照组,差异显著（P＜0.05）。通过用药后对断奶羔羊肠道微生物分析,鱼腥草、大蒜、马齿苋能够提高羔羊肠道菌群的物种多样性和丰富度。在门水平上,鱼腥草、大蒜和马齿苋与空白对照组相比增加了厚壁菌门的丰富度,降低了拟杆菌门的丰富度;而地克珠利与对照组相比降低了厚壁菌门、拟杆菌门的丰富度,大蒜组和地克珠利组与对照组相比增加了变形菌门的丰富度,而鱼腥草组和马齿苋组与对照组相比降低了变形菌门的丰富度。在科水平上分析,鱼腥草、大蒜组和马齿苋组与对照组增加了颤螺菌科的丰富度,而鱼腥草、大蒜组和马齿苋组与对照组相比减少了毛螺菌科的丰富度。在属水平上分析,所有用药组及对照组UCG-005为优势菌属,而鱼腥草、大蒜组和马齿苋组与对照组相比,增加了UCG-005菌属的丰富度,而所有用药组的Rikenellaceae＿RC9＿gut＿group菌属丰度均低于对照组。通过物种差异性分析,大蒜、鱼腥草组和马齿苋组的厚壁菌门占比均高于对照组,差异显著（P＜0.05）,说明大蒜、鱼腥草组和马齿苋组能提高厚壁菌门的丰富度。而且鱼腥草、大蒜和马齿苋组的Lachnospiraceae＿AC2044＿group的菌属高于对照组,差异显著（P＜0.05）。表明鱼腥草、大蒜、马齿苋能提高Lachnospiraceae＿AC2044＿group的丰富度。本研究为药食同源中草药预防羊球虫的感染及肠道菌群提供了重要参考依据。