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目的：比较经颅微电流刺激疗法（CES）和阿立哌唑治疗儿童抽动障碍（TD）的临床疗效、安全性、经济性及依从性，探讨CES对于儿童抽动障碍是否是有效、安全、可行的治疗方法。方法：本研究采用随机、治疗前与治疗后病例对照的临床试验设计方法，诊断标准符合2000年美国《精神病诊断与统计手册》第四版修订本(DSM-IV-TR)关于儿童TD中慢性抽动障碍(CTD)或Tourett综合征(TS)诊断标准。共有75例汉族TD患儿入组，其中CTD44例，TS31例，年龄在5～16岁。随机分为CES组(n=41例)和阿立哌唑组(n=34例)，分别给予CES与阿立哌唑治疗，观察疗程为4周，采用《耶鲁综合抽动严重程度量表(YGTSS)》、《副反应量表（TESS）》评估疗效及安全性。并采用成本-效果分析（CEA），计算成本-效果比（C/E），来评估经济性。结果：（1）治疗前CES组和阿立哌唑组YGTSS总分分别为（34.00±9.41）和（33.64±8.25），无显著差异（P＞0.05），从治疗第2周末起两组YGTSS总分得分均下降，在治疗2周末CES组YGTSS减分率为(17.91±10.44)％，阿立哌唑组YGTSS减分率为(28.60±12.99)％，两组的YGTSS减分率有显著性差异（P＜0.01），CES组下降率明显低于阿立哌唑组；在治疗4周末时CES组的YGTSS减分率[(33.03±19.65)％]也明显低于阿立哌唑组[(52.79±22.87)％]（P＜0.01）。治疗4周后，CES组和阿立哌唑组治疗总体有效率分别为45.71％和76.47％，两组具有显著差异（P＜0.05)。（2）CES组和阿立哌唑组不良反应的发生率分别14.29％和11.76％，差异无显著性（P＞0.05）,且两组均未见严重不良反应。（3）CES组的成本-效果比明显高于阿立哌唑组。（4）在随访期间，CES组有6例中途退出治疗，阿立哌唑组全部完成4周治疗，两组失访率有显著差异（P＜0.05)。结论：CES治疗儿童抽动障碍有一定疗效，不良反应小，但是其较阿立哌唑起效慢，疗效不显著，而且存在依从性较差、治疗费用较高等不足。