基于线粒体DNA的16S rRNA、COⅠ和COⅡ基因的黄脊竹蝗5地理种群遗传多样性研究

来源 :中南林业科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wudongzy
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本论文以线粒体DNA中的16S rRNA基因、COⅠ基因和COⅡ基因为分子标记,对湖南桃江、广东广宁、广西桂林、重庆永昌和四川长宁5个黄脊竹蝗地理种群的遗传多样性及遗传分化进行了分析,得到了以下研究结果:(1)通过PCR扩增出的16S rRNA基因部分序列长506 bp。A、T、G和C平均含量分别为32.0%,37.7%,17.6%,12.7%。A+T含量较高,为69.7%,G+C含量较低,为30.3%,存在着明显的A/T碱基偏向。所测序列经Clustal X1.81软件分析比对,其中保守位点数(C:Conserved sites) 504个,变异位点数(V:Variable sites)2个,简约信息位点数(Pi:Parsimony Information sites)0个,自裔位点数(S:Singleton sites)2个(2)通过PCR扩增出的COⅠ基因序列长640 bp。A、T、G和C平均含量分别为36.8%,33.3%,13.2%,16.7%。A+T含量较高,为70.1%,G+C含量较低,为29.9%,存在着明显的A/T碱基偏向。所测序列经Clustal XI.81软件分析比对,其中保守位点数638个,变异位点数2个,简约信息位点数1个,自裔位点数1个。(3)通过PCR扩增出的COⅡ基因序列长746 bp。A。T、G和C平均含量分别为39.8%,31.7%,13.2%,15.3%。A+T含量较高,为71.5%,G+C含量较低,为28.5%,存在着明显的A/T碱基偏向。所测序列经Clustal XI.81软件分析比对,其中保守位点数742个,变异位点数4个,简约信息位点数0个,自裔位点数4个(4)对5个地理种群黄脊竹蝗的遗传距离分析显示,16S rRNA基因序列间的遗传距离为0-0.004,所有序列的平均距离为0.0016。整个16S rRNA基因序列的碱基转换数为1,颠换数为1。COⅠ基因序列间的遗传距离为0-0.0031,所有序列的平均距离为0.0016。整个COⅠ基因序列的碱基转换数为2,颠换数为0。COⅡ基因序列间的遗传距离为0.0013-0.0027,所有序列的平均距离为0.0021。整个COⅡ基因序列的碱基转换数为3,颠换数为1。总的来看,5个黄脊竹蝗地理种群之间的16S rRNA基因、COⅠ基因和COⅡ基因差异都很小,表明黄脊竹蝗种群分化程度很低,遗传多样性单一(5)以16S rRNA基因、COⅠ基因和COⅡ基因为分子标记,利用邻近法(NJ),最小进化法(ME),和非加权配对算术平均法(UPGMA)构建黄脊竹蝗5个地理种群的系统进化树。根据进化树分析,发现利用NJ法和ME法对同一组基因序列构建的分子系统树拓扑结构完全相同,利用UPGMA法对同一组基因序列构建的分子系统树拓扑结构与NJ法、ME法构建的具有很大的差异。用同一建树方法分别对16S rRNA基因、COⅠ基因和COⅡ基因序列构建的系统树拓扑结构没有形成相同或相似的聚类关系。
其他文献
花器官的生长和着色是影响其观赏品质的两大重要因素,而这两方面又受多种内外因子的调控,其中光和赤霉素(GAs)是最主要的调节因子。非洲菊(Gerbera hybrida)是世界上最流行的五大切
结合深基坑工程支护设计,详细介绍了在深厚粉细砂层中放坡开挖的概念性设计,提出了在深厚粉细砂层中基于各种加固措施的放坡开挖的设计概念,加固措施包括在放坡中部和底部设置一
【正】 1月19日至22日,国务院西部地区开发领导小组在京召开西部地区开发会议。会议认为,实施西部大开发是一项规模宏大的系统工程,也是一项艰巨的历史任务。当前和今后一个
深基坑时空效应分析中,常采用数值模拟及拟合经验公式等方法进行研究,因深基坑时空效应的影响因素复杂,各种因素难以量化,常规的分析方法适应性不强.而目前时空效应分析中,一般只考虑时间或空间效应的影响,尚未建立同时考虑时空效应的人工智能分析模型.对于处理高度非线性的复杂问题,神经网络有独到的优势:基于进化算法的神经网络还具有全局优化功能.在详细分析了时空效应影响因子的基础上,本文尝试建立了利用进化算法分
由于气温的交替变化,处于寒区的混凝土大坝必然产生温度应力.当温度拉应力大于混凝土的抗拉强度时,混凝土大坝闸墩会产生局部裂缝,严重时导致大坝闸墩产生贯穿性裂缝.结合丰满混凝土大坝溢流坝段闸墩加固工程实践,采用非线性有限元数值方法分析了在不同预应力荷载工况下预应力锚固过程中大坝闸墩混凝土的应力变化.本文根据有限元数值计算结果,提出了优化预应力锚索布置和锚固力大小的方法,解决了大坝堰顶处混凝土在锚固过程
一、加强医学生人文素质教育的必要性  人文素质是指一个人成其为人和发展为人才的内在品质,包括人文知识和人文精神。  1.我国现行医学教育模式不利于对学生的人文素质教育  随着社会经济的发展和现代医学科学的进步,传统医学人才培养教育模式的弊端日益凸显。  (1)现行的医学教育受制于呆板的教学计划和课程设置。其主要表现有:在课堂教学中,重视专业知识的传授,忽视人文知识的教育,忽视对学生实践教育中的人文
本文通过热压成型的方法将玻纤布和聚苯硫醚非织造布复合制备出复合板材,探讨了热压温度对复合材料力学性能的影响。结果表明:通过控制热压温度,复合材料的力学性能得到了显
目的:本实验通过对比泄浊解毒方在UC模型大鼠治疗后及第二次造模后血清中白介素10(Interleukin 10,IL-10)含量、结肠组织Toll样受体4(Toll-like receptors 4,TLR4)蛋白表达的变化
丹毒作为外科上比较常见的一类体表感染性疾病,其主要发病机制为患者黏膜细小伤口或者皮肤等部位的皮内网状淋巴管遭受乙型溶血性链球菌感染导,发生于下肢的丹毒被称为下肢丹
随着我国经济水平和城市化建设水平的不断提高,越来越多、越来越高的高层建筑建造在了我国的城市当中。高层建筑也是衡量城市经济水平、建设水平的一个重要标志。但是高层建