随着我国市场经济体制的建立和发展、国家公共财政管理要求的进一步提高,我国财政部于2001年提出了《财政预算国库管理制度改革方案》,从此,我国各级地区逐步开始推行国库集中支付制度改革的相关政策。自2001年以来,国库集中支付制度改革不断地取得了新的突破和发展,并对我国各地区的财政支出改革产生了极其重大的影响。目前,我国国库集中支付制度改革已经迈入了大规模推进和完善的阶段。2005年内蒙古自治区开始实施国库集中支付管理办法。到目前为止,内蒙古自治区包头市的绝大多数高校已经纳入了国库集中支付制度改革的范畴。国库集中支付这一新制度的实施,对现行各地区高校产生了重大影响。在包头市各个高校中实施国库集中支付制度改革已势在必行,为了更好更快的适应改革的发展、充分发挥改革对包头市高校财务管理的积极影响、解决和减轻改革所带来的消极影响,包头市高校财务管理要及时的更新观念,提高财务管理的水平,尽快建立与改革相适应的财务管理制度,以确保包头市高校各项工作的顺利展开,全面提高我国高校财务管理水平,推动我国高等教育事业的持续发展。本文对国库集中支付制度的概念、作用及实施的必要性进行了阐述,并在此基础上,对包头市高校实施国库集中支付制度的现状进行了分析,探究了包头市高校实施国库集中支付制度所面临的种种问题及相关对策。