随着我国创新型国家的建设,科研活动将日益增多,高等学校科研项目规模也会越来越大,高等学校科研经费管理是学校管理的一项主要内容,而且科研项目经费管理的水平和程度直接制约着科研管理水平。因此正确认识加强高校科研经费管理的重要性,分析科研经费管理面临的问题,积极探索加强科研经费管理的有效措施,并构建完整系统的科研经费管理体系,提高科研经费使用效率,成为高校财务管理者面临的新课题、新挑战。目前科研经费在高校收入总额中所占的比重大幅上升,其资金来源也呈现多元化趋势,提高科研经费使用效率,保证新形势下高校科研工作的顺利进行,使其产生更好的社会、经济效益,显得尤为重要。本文共分五章。第一章,导论。介绍了本文的研究背景和意义,当前国内外有关科研经费管理的研究现状,以及论文的撰写思路和主要贡献。高校是我国开展科学研究的一支重要力量。近年来,随着政府增强自主创新能力、建设创新型国家的重大战略决策的顺利实施,高校承担的科研项目和筹措的科研经费均呈现大幅增长趋势,科研经费已成为学校重要的资金来源之一。科研经费管理在高校财务管理中的地位日渐突出。高校对科研活动的管理主要包括科研项目管理和科研经费管理,管理模式多为科研处负责科研项目的管理,财务处负责科研经费的管理。但是,部分高校由于对科研经费管理重视不够,缺乏完善的纵、横向科研经费内部管理制度,在科研经费管理和使用中仍然存在一些突出的问题。因此,必须进一步规范和加强高校科研经费管理,提高资金使用效益,确保高校科研工作健康发展。第二章,高校科研经费管理相关理论。本章主要阐述了高校科研经费的特性和管理原则,引入了财务管理中的“逆向选择”和“道德风险”两大理论,为后文提出新的措施奠定理论基础。本章还从全国高校的层面,概括了当前我国高校科研经费管理存在的问题、原因以及所采取的对策,为后文A高校科研经费管理的研究提供支撑。第三章至第五章,通过具体研究A高校科研经费管理现状,发现由于对科研经费管理的不够重视,科研经费预算监督缺位和项目验收结题与项目结账脱节,同时缺乏有效的绩效评价机制,导致项目管理与经费管理相对独立,科研项目预算、决算与实际开支存在差异,对科研项目经费的过程管理缺乏科学控制,科研资金和资产流失比较严重。通过这些分析,有针对性地提出完善该校科研经费管理体系的措施。本文的主要贡献在于有效地支持科研项目全过程管理,优化目前高等学校科研经费管理模式,使会计核算准确反映高校科研项目的实际运行状况,将高校科研经费管理扩展为事前、事中及事后的全面控制管理,来提高高校科研经费使用效率,使得用最少的科研成本完成科研项目,保证新形势下高校科研工作的顺利进行,使其产生更好的社会效益和经济效益。第一,完善科研经费管理体制。通过创新科研管理组织结构,更新科研经费管理理念,健全科研经费相关制度,通过政策引导和组织保障,促成资源共享、联合攻关的良性机制。第二,完善科研经费预算管理。具体措施是：明确预算管理的目的,把握科研经费预算编制的原则,熟悉掌握科研经费预算编制的方法,并规范科研经费预算编制流程内容。第三,严格控制科研经费核算管理。保证科研项目经费按照项目负责人在项目申报计划中的预算开支,避免项目运作过程中可能带来的经费风险,同时保证项目的实际开支与预算一致。第四,加强科研经费结余管理,按照产生原因的不同采取不同的管理办法。本文在论文写作过程中,做了大量的调查,尽可能的收集相关信息和资料,充分吸收了一些先进的管理理念,以期做到实事求是,有理有据,写有所用。但由于本人学识、能力、经验等方面的局限,未能把科研经费管理体系研究进行更深入的量化分析研究,还需要日后进一步完善。