政府采购的质疑,投诉制度是法律赋予投标人维护自身合法权益的法律救济手段。在政府采购激烈的市场竞争环境中,质疑,投诉现象十分常见。招标代理机构在处理质疑和配合财政部门处理投诉时,如果行为不当,将要承担一定的法律责任。对于招标代理机构而言,一旦项目被质疑,轻则耗费大量资金成本和人力成本,重则可能被暂停从事政府采购业务,直接关系到招标代理机构的生存。因此,如何防止或减少质疑事件的发生,降低或规避质疑发生带来的不利影响,是招标代理机构亟待解决的问题。首先,本论文介绍了政府采购质疑风险的产生原因,分析了质疑风险是如何因为处置不当转变为质疑事件的。表明了建立系统的评估模型对政府采购质疑风险管理的积极作用。其次,论文通过选取近三年“云南省政府采购网”公布的投诉处理案件作为研究样本,对上述投诉案件进行逐一分析,形成政府采购质疑风险清单。在风险清单的基础上,设计了易于操作的风险评估模型。最后,将风险评估模型运用到案例中进行适用性检验。通过案例验证了风险评估模型在政府采购质疑风险管理中的有效性和实用性。本论文希望通过建立对政府采购质疑风险的系统评估模型,估算出各类风险发生的可能性和严重性,提升招标代理机构对质疑风险的认识,为招标代理从业人员如何处置质疑风险提供科学的依据,确保招标采购活动的顺利进行。