改革开放以来，我国经济不断增长，但生态环境问题也日益突出。1998年我国正式建立了资源环境审计制度。资源环境审计是一种行政监督手段，通过对政府和企业的环境管理活动进行检查、鉴证与评价，监督其履行环境责任，规范其环境活动，从而保护环境较少污染，最终实现资源环境的可持续发展。文章将资源环境审计制度变迁历程分为四个阶段，在这四段历程中资源环境审计对象更加多元、审计内容范围不断扩大，审计目标也更加明确。但是，由于我国资源环境审计制度缺少标准化资源环境审计准则和专门的法律体系再加上从业人员缺少统一认证等原因，导致资源环境审计出现工作标准不统一、执行力度不足以及结果不能充分运用等问题，阻碍了资源环境审计制度的发展。文章根据制度创新的理论逻辑分析我国资源环境审计制度变迁历程，可以看出我国资源环境审计从开始研究到具体实践过程中审计对象及范围在不断扩大、审计目标也更加明确。在此基础上，针对我国资源环境审计的制度问题，提出资源环境审计制度进一步发展的建议:首先对传统审计准则的内容进行扩充，构建资源环境审计准则体系;其次在现有法律法规上进行补充逐步构建资源环境审计法律体系;最后明确资源环境审计从业人员的从业资格，同时通过继续教育、培训等方式提高从业人员的业务能力，从而促进资源环境审发挥更大的监督效力。