牛Angptl3基因组织表达、多态性及其与生长性状关联分析

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Angptl3是一种与脂类代谢、葡萄糖代谢和能量代谢密切相关的分泌性蛋白质。本研究以Angptl3基因为研究对象,利用实时荧光定量PCR方法检测其在3头郏县红牛(JX)组织中的表达谱;采用DNA池测序、PCR-RFLP和PCR-SSCP技术对Angptl3基因在郏县红牛、南阳牛、鲁西牛、渤海黑牛、秦川牛和高原牦牛6个群体中共424个个体的遗传多态性进行检测,并分析了遗传变异与其生长性状的相关性,旨在探索Angptl3基因对牛生长发育性状的影响,试图寻找影响牛经济性状的主效基因,为我国地方黄牛的遗传改良提供一定的理论依据,研究结果如下:1. Angptl3基因在郏县红牛组织中的表达谱Angptl3基因在郏县红牛组织中在肝脏中表达量最高,在脾脏和肺脏组织中微量表达,在心脏、肾脏、瘤胃、骨骼肌、脂肪组织、睾丸组织中均不表达。2.牛Angptl3基因群体遗传样性分析在上述6个牛群体上对Angptl3基因编码区进行遗传多态性检测,结果发现3处SNPs: g.104A>T、 g.509A> G和g.8661T> C (与GenBank:NC007301对照),3个突变位点都位于编码区,属于错义突变。g.104A> T位点属于异亮氨酸>苯丙氨酸的错义突变;位点g.509A> G属于谷氨酰胺>精氨酸的错义突变,位点g.8661T> C属于丝氨酸>脯氨酸的错义突变。g.104A> T和g.509A> G两个位点在秦川牛群体中呈现低度多态,在渤海黑牛和鲁西牛群体中呈现中度多态;位点g.8661T> C在郏县红牛、鲁西牛、南阳牛和渤海黑牛4个黄牛群体中呈现低度多态。连锁不平衡分析表明,在黄牛群体中,g.104A> T和g.509A> G位点处于强连锁状态(r2>0.33),而g.104A> T和g.8661T> C间、g.509A> G和g.8661T> C间的连锁极弱(r2<0.33)。3.牛Angptl3基因多态位点与生长性状的关联分析单一位点与性状之间的关联分析表明,在鲁西牛群体中,g.104A> T位点与体高和体斜长指标显著相关(P <0.05),AT基因型大于TT基因型;g.509A> G位点与体斜长显著相关(P <0.05),AA基因型和AG基因型大于GG基因型。在郏县红牛群体中,g.104A> T和g.8661T> C位点不同基因型在各指标间差异不显著(P>0.05),g.509A> G位点与胸围显著相关(P <0.05),GG基因型大于AA基因型。在黄牛群体中3个多态位点的组合基因型与生长性状进行关联分析,结果显示ATAATT基因型个体的体高、体斜长、胸围和坐骨端宽显著高于AAAATT型个体(P <0.05)。可能此组合基因型对黄牛的生长性状具有一定的影响,是有利于黄牛生长的基因型组合。
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