进入21世纪后，随着经济全球化、贸易自由化的发展，我国农业正面临着前所未有的国际、国内双重机遇和挑战。为了抓住机遇，应对挑战，我国政府和学术界均视推进和加速农业产业化为良策。农业产业集群作为农业产业化经营的主要实践形式，在我国发展迅速，但面临着满足消费者需求、降低集群整体运行成本和合理分配集群利益的多重压力。我国农业产业集群还处于发育的低端状态，其核心竞争能力和成长性都明显不足。运用供应链管理方法治理农业产业集群已经引起很多学者的注意，但大量的文献集中在供应链管理与农业产业集群兼容性理论研究领域，而利用供应链管理方法促进农业产业集群优化升级的具体应用则鲜有报道。　　 本文以供应链网络为切入点，探讨了供应链集成下农业产业集群的优化升级问题。首先对农业产业化与农业产业集群发展进行现状分析、识别集群的发展障碍、提出集群的发展目标，指出供应链管理方法是治理农业产业集群的现实需要；然后以陕西苹果产业集群为例，分析农业产业集群发展战略能够顺利实施的客观基础--供应链结构，论证供应链管理方法治理农业产业集群的现实可行性；再而通过建立农业产业集群的一般分析性框架，解构农业产业集群，描述农业产业集群的动态演化特征；最后依据农业产业集群的发展目标(满足消费者需求、降低集群供应链运行成本、均衡利益分配)，分别建立模型，提出农业产业集群优化升级策略。本文研究成果如下：　　 1.论证“运用供应链管理方法治理农业产业集群”这一发展战略能够满足我国农业产业集群发展的现实需要。根据我国1990年以来的投入产出表及其延长表的特点，改进了Furtuoso等设计的涉农综合体GDP的测度方法，对我国涉农综合体GDP进行测算，以此定量衡量农业产业化水平；并通过与荷兰涉农综合体GDP的对比，发现我国当前农业产业化发展程度比较低，还存在很大的发展空间。采用波特“钻石”模型分析了新疆兵团棉花、云南斗南花卉、黑龙江奶业、金乡大蒜、马陆葡萄、内蒙古肉牛业、寿光蔬菜和陕西渭北苹果这八个案例中集群发展情况，总结农业产业集群中存在的问题。提升农业产业集群竞争力需要克服上述发展障碍，即农业产业集群需要达到如下三个发展目标：(1)满足消费者对农产品的要求，提高市场应变能力；(2)提高农业产业集群整体利益，降低集群运行成本；(3)促进集群利益的合理分配，健全利益联结机制。进一步分析农产品特点、农业产业集群发展目标和供应链管理之间的关系，论证“运用供应链管理方法治理农业产业集群”这一发展战略的实施可以促进农业产业集群优化升级，提升农业产业集群竞争力。　　 2.论证我国农业产业集群具有实施“运用供应链管理方法治理农业产业集群”这一发展战略的客观基础。在对供应链管理以及产业集群相关概念的辨析的基础上，分析了供应链集成下农业产业集群所表现的特殊性质，揭示了供应链管理方法治理农业产业集群的理论可行性；以陕西渭北苹果产业集群为例，从供应链类型，供应链生产、组织过程角度，分析了农业产业集群供应链网络结构，指出了农业产业集群的供应链网络结构是客观存在的，论证了“运用供应链管理治理农业产业集群”这一战略得以实施的现实可行性。　　 3.给出供应链集成下农业产业集群的一般分析性框架，便我们分析农业产业集群在显现期、发展期、成熟期各个阶段的演变特征，为描述农业产业集群的发展状态特征提供了一个参考体系。从供应链管理视角，以系统论方法的基本思想为基础，描述了农业产业集群的被管理系统、管理系统、信息系统、企业治理四个维度及相关变量。以集群生命周期模型的基本思想为基础，描述了四维度变量随集群动态演变的特征。根据农业产业集群相关研究文献，给出了农业产业集群四个维度相关变量在显现期、发展期、成熟期各个阶段的取值，建立一般分析性框架。　　 4.以集群供应链网络中存在的不确定性来源作为改善集群网络链绩效的驱动因素，建立不确定性来源-供应链重构策略匹配模型，即不确定性应对模型。以“满足消费者对农产品的要求，提高市场应变能力”为目标，基于农业产业集群的一般分析性框架罗列供应链重构策略，识别农业产业集群网络链的不确定性因素来源，形成不确定性来源-供应链重构策略匹配表，构建不确定性应对模型；在马陆葡萄产业集群的应用说明了该模型的有效性。集群企业和相关利益主体根据这一模型能够综合了解具体的供应链重构策略能够为集群企业和相关利益主体做些什么以及能够达到什么样的效果。集群企业和和相关利益主体在面对集群供应链网络中存在的不确定性情况时，能够通过识别不确定性来源，根据这一模型选择有效的供应链重构策略。　　 5.建立了以最小化集群网络链生产成本和运输成本之和为目标函数的空间配置模型。以“提高农业产业集群整体利益，降低集群运行成本”为目标，在给定农业产业集群主要市场区域对农产品需求量的条件下，空间配置问题主要处理供应链环节最佳选址及生产规模选择问题，以最小化农业产业集群供应链网络系统的生产加工和运输成本。以选址-分配模型为基础，建立了空间配置问题的混合整数线性规划模型。采用UNGO求解模型可获取最优配置方案，据此选择加工厂区位和生产规模可使集群网络连运行成本最低，改善集群网络链系统的运行绩效。空间配置模型应用到陕西苹果产业集群案例的求解结果和敏感度分析表明了模型的有效性。这一模型能够为集群供应链网络企业改变加工厂区位、生产规模以及合作伙伴的选择提供有效指导，实现降低集群供应链网络运行成本的目标。　　 6.建立了基于收益共享合同的集群供应链成员利益分配模型。以“促进集群利益的合理分配，健全利益联结机制”为目标，从供应链管理视角，将集群内成员间利益分配问题转换为集群内网络链成员的利益分配问题，利用协调供应链的收益共享合同作为利益分配机制。将利益分配问题分解为基于收益共享合同的供应链协调问题和收益共享系数确定问题。针对随机产出和随机需求下由单一生产商和单一零售商组成的两阶段农产品供应链协调问题，建立了基于收益共享合同的链协调模型，采用凸分析方法得出了供应链协调的条件，说明了合同参数批发价ω与收益共享系数Φ的关系和Φ设定范围。通过理论分析和算例验证，得出收益共享合同可以协调随机产出和随机需求下单一生产商和单一零售商组成的两阶段供应链。采用改进Shapley值方法求解多人合作博弈问题，确定收益分享系数，完成利益分配模型的求解。为克服传统Shapley值方法忽视成员面临风险的不同的不足，引入风险修正因子。通过建立评估农产品供应链成员风险的层次结构指标体系，采用层次分析法确定各成员面临风险的相对大小。基于风险因子修正Shapley值方法综合考虑供应链各成员面对的风险大小和边际贡献，可使最后的利益分配结果更合理。　　 综上，一般分析性框架为农业产业集群的发展程度分析提供了参考；不确定性应对模型为集群企业和利益相关主体选择有效供应链重构策略提供了指导；空间配置模型和利益分配模型则针对具体的发展目标提供了最优选择方案。它们能从不同侧面改善农业产业集群网络链(四维度)的运行绩效，提升农业产业集群的竞争力。