本文运用定量计算、定性描述与综合集成三类研究方法，对奈曼旗的生态经济系统及生态、经济、社会效益进行了综合分析研究。用生态足迹方法评价奈曼旗1993～2003年可持续发展状况；运用家庭物质流核算与分析方法对奈曼旗2003年家庭物质流进行了分析，得出奈曼旗在资源利用上没有形成完整的循环过程，是一次性利用；国际通用方法计算评价奈曼旗荒漠化程度；通过对近11年典型村农业生态经济系统综合分析，四个类型区的典型村经过11年生态经济的建设，由非生态农业阶段发展到了初级生态农业阶段；根据以上分析的结果，本文提出了奈曼旗区域生态经济复合系统的综合控制体系；并对典型村生态效益、经济效益、社会效益及奈曼旗生态经济优化模式设计体系的价值进行了分析，结果显示发展生态经济给奈曼旗带来的综合效益是显著的，生态经济优化模式体系是可行的。