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稻瘟病是世界上最重要的水稻病害之一，每年都造成很大的损失。抗病品种的选育是防治稻瘟病的主要途径。随着DNA分子标记的出现与迅猛发展，标记辅助选择(Marker-Assisted Selection，简称MAS)技术己成为抗病基因正确选择的有效途径。但由于抗病基因与分子标记间的重组率在不同的群体中有较大的差异，同时构建分子标记的群体往往不是育种材料本身，在实际应用中有一定局限性。另外，由于目前已建立的分子标记不是基因本身，在育种大量群体中可能出现目的基因与分子标记不连锁的情形，导致抗病基因选择的失败。