本研究以笃斯越橘及其白果变种成熟期果实为试材,应用常规方法测定营养指标,采用HPLC法测定10种类黄酮化合物含量,应用高通量测序技术,进行转录组测序,将试验结果进行综合分析,得出结论如下：1.白果变种与笃斯越橘的成熟果实营养指标比较,白果变种成熟果实可滴定酸、还原型抗坏血酸含量较低,笃斯越橘成熟果实还原糖、可溶性糖、多酚、类黄酮、花青素含量较高。2. HPLC法测定的10种类黄酮化合物,其中对香豆酸、二氢杨梅素、儿茶素、表儿茶素含量,白果变种高于笃斯越橘；山奈酚、杨梅素、槲皮素、二氢槲皮素、原花青素B2、矢车菊素-3-葡萄糖苷含量,笃斯越橘高于白果变种。3.通过对笃斯越橘与白果变种转录组测序,共获得34.62 Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到5.30 Gb,Q30碱基百分比在88.73%及以上；组装后共获得89,725条Unigene。其中长度在lkb以上的Unigene有20,473条；对Unigene进行功能注释,共获得42,837条Unigene的注释结果。全部差异表达的基因数量是325个,其中上调表达数量是41个,下调表达基因数量是284个。4.类黄酮生物合成途径中,差异表达的酶类共4种,其中上调表达酶类3种,下调表达1种；路径相关基因共计80个,DEGs基因数量3个；类黄酮路径结构基因11个,其中上调表达基因数量是9个,下调基因表达量是2个；转录因子差异表达的共计7个,其中5个显著上调表达,2个显著下调表达。5. MADs-box与MYB3转录因子协调作用,可能导致CHI与LAR下调表达,进而影响白果变种果皮着色出现问题。