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植物的NPF转运体家族介导硝酸根、小肽、植物激素和多种植物次生代谢物的跨膜转运。通过对植物NPF家族的进化关系的分析，发现OsNPF3.1转运体与黄瓜叶绿体膜上的亚硝酸根转运体Nitr同源。OsNPF3.1转运体定位于细胞质膜，而非叶绿体内膜，故不可能参与亚硝酸根进入叶绿体的过程。表达于爪蟾卵母细胞的OsNPF3.1转运体能促进硝酸根的积累，且积累强度受pH影响，证明OsNPF3.1转运体是一个质子依赖的硝酸根转运体。OsNPF3.1基因表达于水稻根中柱和叶片的叶脉中。正常生长条件下，敲除OsNPF3.1基因的水稻突变体的生长发育与其野生型一致。过量表达OsNPF3.1基因的转基因植株在正常条件和低硝酸根条件下的生长与其野生型并无差异。最近有研究表明，拟南芥的AtNPF3.1转运体是赤霉素/脱落酸转运体，而OsNPF3.1转运体也具有赤霉素转运体活性。过量表达OsNPF3.1基因的转基因植株的生长对赤霉素处理的响应与其野生型一致。相较于其野生型，过量表达OsNPF3.1基因的转基因植株的根部的生长对脱落酸处理不敏感而地上部的生长则对脱落酸处理更敏感。 通过酵母功能互补发现OsNPF8.1转运体是一个小肽转运体，能转运多种二肽和三肽。OsNPF8.1转运体定位于细胞质膜上，介导小肽进入细胞的过程。OsNPF8.1基因在除了根表皮外的所有组织中均有表达，表明其不参与水稻根对外界小肽的吸收。OsNPF8.1基因的表达受器官衰老和缺氮的诱导，表明其可能参与衰老和缺氮条件下有机氮的转移和再利用。另外，通过酵母生长实验证实含有芳香族侧链的二肽Trp-A1a可以被拟南芥的小肽转运体AtPTR1(AtNPF8.1)和AtPTR5(AtNPF8.2)转运，否定了其作为竞争性抑制物的推测，暗示这些质子依赖的转运体可能存在不依赖离子的转运途径。