【摘 要】
：
谷子白发病是由禾生指梗霉引起的一种卵菌病害,在谷子整个生育阶段均有发生,且会表现出不同的发病症状,严重时可以极大地降低谷子产量和品质。目前国内外对谷子白发病的机制研究较少。因此,本研究拟通过WGCNA对晋谷21（高感白发病）和G1（高抗白发病）两个品种苗期的转录组数据及对两品种重测序数据的分析和比较,从两方面阐明晋谷21和G1品种的抗病差异,以及初步阐释谷子抗感白发病菌的分子机制。主要研究内容如下
【基金项目】
：
国家自然基金（31771810、31471556）； 国家重点研发（2018YFD01000700）； 国家自然科学基金青年基金项目（31701440）； 山西省重点研发项目（201703D211008）； 山西省应用基础研究计划项目（201701D221183）
论文部分内容阅读
谷子白发病是由禾生指梗霉引起的一种卵菌病害,在谷子整个生育阶段均有发生,且会表现出不同的发病症状,严重时可以极大地降低谷子产量和品质。目前国内外对谷子白发病的机制研究较少。因此,本研究拟通过WGCNA对晋谷21（高感白发病）和G1（高抗白发病）两个品种苗期的转录组数据及对两品种重测序数据的分析和比较,从两方面阐明晋谷21和G1品种的抗病差异,以及初步阐释谷子抗感白发病菌的分子机制。主要研究内容如下:（1）通过对谷子LRR-RLK的家族基因分析,包括:谷子LRR-RLK类基因的鉴定及基因定位、基因的结构、基因的保守基序及保守结构域、系统进化及基因组间共线性分析。谷子LRR-RLK类家族基因共250个,大多数的LRR-RLK类家族基因主要分布在第8号染色体上;且结构域有10段保守序列,并且该家族系统进化树被分为3类;通过基因结构分析表明,Motif1和Motif3在较其他Motif是最为保守的;有许多个个LRR-RLK家族基因与狗尾草存在共线性。（2）通过对接种白发病菌的抗感谷子品种（晋谷21和G1）的苗期36份转录组数据的差异表达基因和得到的LRR-RLK家族抗病基因进行WGCNA分析,确定差异基因最多的模块,晋谷21和G1的幼苗在受谷子白发病菌的侵染后,共有17077个差异表达基因,这些基因可划分为44个模块,随后选取其中的3个与抗病相关的模块进行网络可视化分析,利用Tbtools软件对特异模块中的基因进行GO富集分析,这些模块基因分别富集到蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶的调控,激素介导的调节及细胞程序性死亡等相关通路,最后挖掘出了12个hub基因Seita.9G071200、Seita.9G456400、Seita.7G183700、Seita.8G148400、Seita.9G307500、Seita.9G115300、Seita.9G090900、Seita.9G101200、Seita.2G372300、Seita.9G485400、Seita.6G000400、Seita.5G323800,预测出8个候选基因Seita.9G307500、Seita.9G456400、Seita.9G163300、Seita.9G203800、Seita.9G386400、Seita.9G273500、Seita.9G525900、Seita.9G101200,在谷子抗病过程中,这些基因有可能发挥非常重要的作用。（3）基于高感品种晋谷21和高抗品种G1的重测序数据,以Setaria＿italica＿v2.2为参考基因组,从重测序数据分析方面进一步分析两品种差异,如:数据评估、与参考基因组比对、变异检测等。本研究通过生物信息学方法探索晋谷21和G1两个谷子品种在纯合突变、杂合突变、非同义突变、SV结构变异中插入、缺失以及外显子区变异、移码突变,以及在GO富集分析中的催化活性、细胞部分、细胞外区域、细胞过程、免疫系统的过程、对刺激的反应、代谢过程和核酸结合的转录因子活性等条目中有很大的差异,这些差异很有可能就是导致两品种抗感机制不同的原因。综上所述,通过对250个LRR-RLK家族基因进行生物信息学分析,为进一步对谷子抗病基因的研究、鉴定和功能验证提供了理论基础。通过WGCNA分析,我们挖掘到谷子抗病相关的候选基因,为深入研究谷子的抗病性机制提供了重要的理论依据。通过重测序分析,发现G1品种的各变异位点、非同义突变及变异基因等均多于晋谷21品种,尤其是非同义突变、In Del杂合突变等在G1品种中的数量远大于晋谷21,其研究结果为进一步探究晋谷21和G1品种的抗感差异及晋谷21抗病改良提供一定的理论借鉴。
其他文献
两汉时期的经学对魏晋时期的文人有着深远的影响,这体现在当时的文学创作中。就曹丕而言,他的经学思想对他的文学观念和实际创作都有着切实的影响,其中散文尤其明显。经世致用、追求不朽等传统儒家观念也存在于他的散文中,这体现出曹丕对儒家传统文艺观念的回归。
中国乡村的发展从1978年改革开放到现在,经历了萌芽、探索、高速发展、成熟四个时期。现阶段我国乡村处于成熟、稳定的发展时期,在国家的背景下,乡村景观呈现出巨大的需求。乡村景观的规划设计是一项基础性工作,可以美化村庄环境,改善村庄生活条件,带动乡村旅游发展。故笔者以生产、生活、生态“三生”的视角,对乡村景观进行规划设计,以求达到旅游助力乡村振兴的目的。首先,对乡村旅游、乡村景观、“三生”等概念与理论
背景先天性肛门直肠畸形（anorectal malformation,ARM）是婴幼儿时期最多见的先天消化系统畸形,发病率约1/5000。女婴和男婴不全相同,女婴大多伴有瘘口,占52.2%,例如直肠前庭瘘、阴道瘘、会阴瘘等。直肠前庭瘘（rectovestibular fistula,RVF）是女童中最多出现的一种肛门闭锁类型。造成肛门直肠畸形的主要因素目前还不清楚,有学者指出,基因遗传因素和社会环
背景颜面部皮肤裂伤作为整形外科急诊中最常见的病种之一,为了寻求更好的治疗效果,整形外科医生们不断探究新的缝合方法和缝合材料。大量研究已经证明,颜面部皮肤裂伤经整形外科美容缝合治疗后,可以取得较好治疗效果。而医用组织粘合剂的使用给儿童颜面部皮肤裂伤提供了新的选择。医用组织粘合剂是一种具有强组织相容性的材料,主要成分是N-丁基-2-氰丙烯酸盐。它在与组织液接触后可迅速聚合成固态薄膜,牢固粘附皮肤,从而
研究背景及目的目前创伤的救治和修复被认为是公共卫生领域的主要挑战之一。根据世界卫生组织发布的报告,跌倒和道路交通事故导致意外伤害的比例在逐年增加,其中面部创伤的发生率也在逐年上升。目前大部分文献分析颌面部外伤（包括软组织创伤、颌面部骨折以及软组织创伤伴颌面部骨折）的流行病学特点,鲜有学者研究单纯面部软组织创伤的流行病学。而随着时代的进步,人们愈发重视外在形象,很难接受面部软组织外伤后急诊治疗出现的
小麦是我国的主要粮食作物,增加小麦产量、提高品种抗性是小麦育种的重要目标。利用EMS处理小麦种子,改变其DNA结构,构建突变体库,是获得优异种质资源的重要途径,同时也是功能基因研究的有力工具。本论文以EMS诱变获得的晋麦90 M3和M4家系、矮抗58的M3家系、以及山农22、济麦22和良星99的蜡质缺失突变体为试材,对晋麦90 M3和M4家系、矮抗58的M3家系、进行全生育期农艺性状调查,筛选表型
思政教育与“大学语文”教学深度融合，是通识课程落实“立德树人”教育根本任务的重要途径。“大学语文”在培养学生思想道德素质、厚植学生民族精神等方面具有独特优势，教师应针对教学中观念、方法层面存在的深层次问题，在思政元素挖掘、教学内容优化和课例开发等方面下功夫，有效提升学生的人文修养和思想道德素质，最终达成以德育人、以文化人之根本目标。
蝽科是半翅目昆虫的一个较大类群,绝大多数种类为植食性。横纹菜蝽Eurydema gebleri和斑须蝽Dolycoris baccarum是蝽科最常见的两种农业害虫,在我国分布范围广。以往的研究主要集中于形态学特征的描述,对这两种害虫的生活史和生物学特性等方面的研究不够深入。因此,本研究拟通过田间观察和室内饲养相结合,对蝽科两种重要害虫的生物学特性进行研究,描述了不同发育时期的形态特征、生活史和生
研究背景及目的日光性角化病（actinic keratosis,AK）是一种上皮内角质形成细胞异常增生病变,通常发生在成人受阳光照射的区域,最早在1826年由Dubereuilh提出,又称为光线性角化病或光化性角化病。目前认为主要诱发因素是紫外线照射。病损表现为出现在面部、颈部等部位单发或多发的红色斑块或色素沉着,表面有鳞屑或者角化,周围可有红晕,也可出现糜烂和结痂,皮损直径约数毫米至两厘米左右。
研究背景及目的良性腮腺肥大（Benign Parotid Hypertrophy）是一种非肿瘤性、非炎性、慢性、无痛的唾液腺良性肿大。其特征是双侧腮腺肿大,不伴没有唾液分泌障碍,病理学上一般表现为腺泡细胞肥大,同时伴导管细胞增大或萎缩。良性腮腺肥大的发病机制目前尚不清楚,推测或与自主神经病变相关,亦有研究提出是腮腺腺泡细胞水通道蛋白5（Aquaporin 5）功能亢进所致。从病因学来说,目前的研究