鹅PRL基因5’-UTR多态性及其与鹅重要经济性状的关联性研究

来源 :安徽农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:huei59
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催乳素(Prolactin,PRL)具有抑制卵泡生长发育,调节母禽就巢和孵卵等母性行为的重要作用,血浆中PRL水平受到PRL基因的调控。本研究旨在分析鹅PRL基因5’-UTR的多态性及其与鹅重要经济性状的关联性。试验采用莱茵鹅、朗德鹅、白罗曼鹅、扬州白鹅、雁鹅以及皖西白鹅与四川白鹅的杂一代(皖川白鹅)作为研究群体。从鹅血液中提取基因组,利用PCR技术克隆PRL基因的5’-UTR及部分调控区序列,长度为268bp(PRL268);利用测序、结构预测、SNP检测、双报告基因表达验证及关联分析等方法进行PRL268序列功能及其与鹅重要经济性状的关联性研究。结果表明:(1)PRL268序列1~13bp之间的DNA平均弯曲指数为33.99±5.88,33~53bp和61~70bp之间分别为51.74±3.81和52.17±3.96,但84~113bp之间仅为18.05±6.06,随后出现120bp(45.88)的波峰和145~163bp的绵延峰,显示这些区域DNA弯曲可能具有功能上的特异性。分析PRL268序列的潜在转录因子结合位点,结果表明该片段存在TBP、NF-1、NF-E2、TATA-box、Pit-1、PR、Sp1、AP-1、CAC-binding_pro等调控元件,而由于DNA-loop的特性,拉近了一些结合位点之间的线性距离。(2)在位距PRL基因CDS起点上游10bp处存在一个T→G的突变位点(T-10G,PRL268T/G)。PRL268G在莱茵鹅、白罗曼鹅和郎德鹅中基因频率均在0.90以上,扬州白鹅为0.1563,皖川白鹅和雁鹅分别为0.3517和0.5566。(3)双报告基因分析显示,PRL268G启动子的效率比PRL268T启动子提高26.14%(p<0.01)。在T-10G位点的T被替换成G后,启动子效率显著提高了。(4)根据基因频率分布和鹅产蛋水平,PRL268G在莱茵鹅、朗德鹅和白罗曼鹅中为优势基因,PRL268T基因在扬州白鹅中为优势基因。结果显示,在不同产蛋水平的鹅群中,基于T-10G位点的基因频率分布具有明显的差异。(5)分析不同基因型皖川白鹅各胴体性状的差异表明,除GG型的宰前活重和胸腿肌率显著地大于TT型外,其他性状在不同基因型之间没有显著差异。
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