染色体6q25.1区域与TOX3基因单核苷酸多态位点与福建人群乳腺癌易感性:关联分层分析

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目的:乳腺癌是全球女性最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁着各国妇女的健康。乳腺癌的发生和发展是环境危险因素与自身遗传因素协同作用的结果。相关研究表明,遗传背景的异质性可能影响不同个体在相同环境暴露下对乳腺癌的易感性。到目前为止,部分高外显性基因,如乳腺癌易感基因1(BRCA1)等,已被证实是与乳腺癌发病相关的重要遗传易感基因。但是大约只有20-25%的家族性乳腺癌病人可以归因于这些高外显基因的病变,并且其在普通人群中出现的频率较低,只能解释5%不到的散发性乳腺癌。SNP(Single nucleotide polymorphism),即单核苷酸多态性,是相关易感基因引起疾病易感性的重要表现形式之一,是当前人类可遗传变异中最常见的一种,遍布于整个人类基因组中。近几年来,全基因组关联研究(GWAS)挖掘出了许多与乳腺癌有关的单核苷酸多态位点,然而这些位点与乳腺癌发病的相关作用机制仍不明确。因此,我们拟选取染色体6q25.1区域位点rs2046210及TOX3基因位点rs4784227作为与乳腺癌患病风险相关的重要遗传变异位点,探讨其与福建省人群乳腺癌遗传易感性的关系,并进一步依据乳腺癌传统流行病学危险因素以及不同分子亚型进行关联分层分析,研究位点rs2046210与rs4784227基因多态性在不同条件下对乳腺癌发病风险的影响。方法:采用病例对照研究的设计,针对染色体6q25.1区域的rs2046210以及TOX3基因的rs4784227两个重要遗传多态位点,纳入702例乳腺癌患者以及794例健康对照,经外周血白细胞提取基因组DNA,应用SNP scanTM方法进行基因分型。以非条件logistic回归分析模型计算相关多态位点与乳腺癌风险的比值比(OR)及其95%可信区间(95%CI),描述不同基因型在不同条件下与乳腺癌易感性的关系。结果:位点rs2046210的等位基因G与A在病例组中的分布频率为55.8%、44.2%,在对照组的分布频率为63.0%、37.0%。位点rs4784227的等位基因C与T在病例组中的分布频率为68.8%、31.2%,在对照组中的分布频率为73.1%、26.9%,差异均具有统计学意义(P<0.05)。非条件Logistic回归分析模型结果提示,与位点rs2046210的GG基因型相比,携带GA基因型的个体患乳腺癌的风险增加了63%(OR=1.63,95%CI=1.29-2.13,P=1.9×10-5),携带AA型基因的个体患乳腺癌的风险增加了68%(OR=1.68,95%CI=1.21-2.33,P=0.002),携带A等位基因者(即GA+AA)患乳腺癌的风险则增加了66%(OR=1.66,95%CI=1.32-2.10,P=1.8×10-6)。对于位点rs4784227,携带T等位基因(即CT+TT)的个体比携带CC基因型的个体患乳腺癌的风险增加了27%(OR=1.27,95%CI=1.03-1.56,P=0.032)。分层分析发现,对于rs4784227的T等位基因携带者,其危险效应在绝经后妇女(校正OR=1.44,95%CI=1.44-1.87)中更为明显,进一步的异质性检验证实,绝经前与绝经后的两个亚组中存在着一个临界异质性P值(P=0.064),表明两个亚组之间可能存在一定的层间异质性,提示对于携带rs4784227-T等位基因的个体来说,其在绝经后患乳腺癌的风险比绝经前更高。结论:染色体6q25.1区域位点rs2046210以及TOX3基因位点rs4784227与福建省汉族人群乳腺癌的易感性存在关联。
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