近年来,政府专项资金支出占财政支出的比重越来越大,但使用效果并不理想,还存在不注重经济效益、社会效益和生态效益等问题。社会公众对政府专项资金的关注点,由支出是否合法合规转变为管理使用是否具有经济效益。在上述背景条件下,传统财政财务收支审计已经不能满足审计环境变化发展的需要,迫切需要加强政府专项资金绩效审计,发挥其对政府专项资金管理使用效益等方面的有效监督作用。本文基于公共受托责任理论、新公共管理理论,采用规范研究法和比较研究法两种方法,对政府专项资金绩效审计进行研究。首先,本文借鉴相关文献资料,阐述了专项资金绩效审计的内涵和理论基础;其次,通过统计分析审计署网站公布的2013——2015年审计公告,归纳总结出目前我国政府专项资金绩效审计存在的问题;接着对专项资金绩效审计开展较好的美、英、澳三国专项资金绩效审计特点进行分析,总结它们成功的先进经验,从中得出在我国开展专项资金绩效审计的有益启示;最后,针对我国政府专项资金绩效审计开展过程中存在的问题,结合国外的先进经验,提出推动我国政府专项资金绩效审计的政策建议。本文的主要贡献是通过横向对比和纵向统计分析,获得一些我国政府专项资金绩效审计问题的新发现。研究发现我国现行政府专项资金绩效审计仍然采用传统的财务审计思维模式,但绩效审计的体制要求、人才素质要求以及采用的评价标准、评价方法、原则、程序等都与传统财务审计有很大的不同,这是造成我国政府专项资金绩效审计发展缓慢的根本原因。根据研究发现,提出针对性的政策建议,对促进我国政府专项资金绩效审计发展具有一定的价值。本文的局限是研究不够深入、细致,未来可以针对政府专项资金绩效审计的具体细节进行研究,提出更具操作性的对策和建议。