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兰科(Orchidaceae)是被子植物中的大科，蕴含许多重要的观赏植物与药用植物种类。自然条件下兰科植物的种子萌发和原球茎生长依赖共生菌获得全部营养，形成偏利性共生关系。而大量混合营养型绿色兰科植物在成株期与菌根菌形成互惠共生关系。具有重要观赏价值的兰属(Cymbidium)植物其成株根系中广泛存在菌根菌。本研究对广东、湖北、云南、贵州四省区的兰属植物菌根真菌和内生真菌进行了分离鉴定，根据形态学特征和rDNAITS序列分析，初步探讨了兰属植物内生真菌类群多样性以及兰属植物与其共生菌之间的专一性。在人工合成大花蕙兰菌根的基础上，摸索大花蕙兰菌根总RNA提取方法，建立了大花蕙兰菌根总RNA提取技术体系，从而为深入探讨兰花与菌根菌共生的分子机理奠定了基础。本论文主要研究结果如下：
(1)从湖北、贵州、云南、广东四省区的兰属植物的营养根上共分离获得真菌菌株82株，并对这些菌根真菌进行了形态观察和描述。
(2)提取所分离菌株中的43个菌株的DNA，通过PCR扩增筛选出真菌的特异性引物为ITS1/ITS4及ITS1F/ITS4，并对PCR扩增产物进行测序、比对分析，结合各菌株的形态特征将34个真菌鉴定到与已知14个属近似，9个已经鉴定到科或科以上水平。其中与镰刀菌属(Fusarium)近似的有18株，相对分离频率为54.5％，镰刀菌属为优势菌群。分离出常见兰科丝核菌类真菌4株，初步鉴定为瘤菌根菌属(Epulorhiza sp.)、胶膜菌属(Tulasnella sp.)。
(3)对兰根rDNAITS序列比对分析发现，40个PCR产物中，有36个有测序结果，其中有5个测序结果经比对发现是兰科植物基因，31个是内生真菌，大多属于担子菌和镰刀菌。
(4)分别采用CTAB/酸酚法、SDS/酸酚法、Qiagen植物RNA提取试剂盒和天恩泽植物柱式RNAout试剂盒等方法提取大花蕙兰菌根及茎叶的总RNA，结果天恩泽植物柱式RNAout试剂盒提取效果最佳，确定为大花蕙兰菌根总RNA提取方法。