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J亚群禽白血病病毒(Subgroup J of Avian Leukosis Virus,ALV-J)是90年代最初从商品代肉鸡中分离鉴定出来的禽白血病病毒(Avian Leukosis Virus, ALV)新的亚群,根据病毒中和试验、交叉干扰试验和基因组序列,确定它与经典的A,B,C,D,E亚型ALV不同。ALV-J主要引起肉鸡的骨髓瘤白血病(Myloid Leucosis,ML)。我国于1999年首先在肉用型鸡群分离鉴定出ALV-J的中国株。本研究以J亚群禽白血病病毒(ALV-J)蛋鸡分离株SD07LK1感染的鸡胚成纤维细胞(CEF)基因组DNA作为其前病毒基因组模板,根据已发表序列设计合成9对引物,经PCR扩增出9段连续的、相互部分重叠的DNA片段和闭合环形前病毒两末端LTR的连接区段,并分别连入T载体进行克隆、测序。然后利用DNAstar软件对测序结果进行剪辑和拼接,首次完成了ALV-J蛋鸡分离株SD07LK1的前病毒全基因组核苷酸序列。将该序列与另外已完成的全基因组序列的比较表明,ALV-J的整个基因组gag和pol基因相对保守,各毒株间对应基因的同源性分别在95.0%以上,env基因的同源性仅为88.6-94.0%。结果表明,该毒株的cDNA基因组有7734个碱基。ALV-J的主要基因和基因组功能片段是5’LTR、gag基因、pol基因、env基因、3’LTR,上述各个基因产物及基因组功能片段又包括若干个亚片段。本研究将J亚群禽白血病病毒中国蛋鸡分离株株SD07LK1与英国病毒株HPRS-103、美国病毒株ADOL-7501及中国肉鸡分离株NX0101的各基因片段做了比较(SD07LK1与HPRS-103、ADOL-7501及NX0101,以下比较均按此顺序): 5’LTR的核甘酸序列同源性为95.4%、92.6%、94.2%。5’LTR区由U3、R、U5构成,对这三个基因片段进行比较,其同源性分别为95.5%、91.1%、93.8%;100%、100%、100%;93.6%、94.9%、93.6%。5’UTR的核甘酸序列同源性为95.5%、95.0%、96.3%。gag基因的氨基酸序列同源性为98.0%、96.6%、96.6%。gag基因负责编码病毒内部结构核衣壳蛋白,主要有:p19、p2、p10、p27、p12、p15。对gag基因的不同编码产物与HPRS-103、ADOL-7501及NX0101的相应基因序列作比较,其同源性分别为96.8%、94.8%、98.1%;100%、100%、100%;98.4%、100.0%、98.4%;100.0%、97.1%、94.1%;95.5%、96.6%、94.4%;96.8%、95.2%、99.2%。pol基因编码一种反转录酶,其氨基酸序列同源性为98.9%、99.1%、98.1%。pol基因的编码产物是RT p68和IN p32。对pol基因的不同编码产物做了比较,其同源性为99.0%、99.7%、97.9%;99.3%、97.9%、98.3%。囊膜蛋白env基因的同源性为91.6%、87.3%、91.7%。env基因由gp85基因和gp37基因组成,对其氨基酸序列作比较,同源性为89.0%、81.8%、89.3%;93.9%、93.4%、93.9%。3’UTR基因的核甘酸序列同源性为86.0%、87.9%、67.2%。3’LTR的核甘酸序列同源性为95.4%、92.0%、93.5%。3’LTR区由U3、R、U5构成,对这三个基因片段进行比较,其同源性分别为95.6%、91.2%、92.5%;100%、100%、100%;93.6%、92.3%、94.9%。