猪圆环病毒（Porcine circovirus，PCV）是一种单链、环状DNA病毒，为圆环病毒科(Circoviridae)圆环病毒属(Circovirus)成员，包括猪圆环病毒1型(PCVl)和猪圆环病毒2型(PCV2)。PCV1对猪群无致病性，而PCV2能引发猪圆环病毒相关疾病(PCVAD)。分子流行病学调查证实，当前猪群中PCV2的流行基因型为PCV2a和PCV2b，其中以PCV2b为主。尽管研究者已经开发了众多PCV检测方法，但至今尚无一种快速、灵敏、可靠并被大家广为接受的方法用于检测PCV2a与PCV2b，也无检测PCV Rep蛋白抗体的ELISA方法。为此，本论文进行了PCV2a和PCV2b的环介导等温核酸扩增法（LAMP）和PCV Rep蛋白抗体间接ELISA检测技术研究。　　 本论文基于PCV2a和2b的标签序列分别设计了特异性LAMP引物，并对反应体系中内引物浓度、甜菜碱浓度、dNTPs浓度、反应温度进行优化。结果表明，该方法的检测灵敏度为1拷贝/反应，整个反应过程在65℃水浴锅中仅需1小时即可完成。特异性试验表明，该方法与PCV1、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合症病毒、牛病毒性腹泻病病毒、猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒、轮状病毒等无交叉反应性。对52份临床病料的检测表明，该方法与巢式PCR的符合率为92.3％。　　 以原核表达并纯化的PCV2 Rep蛋白为包被抗原，建立了检测PCV Rep蛋白抗体的间接ELISA方法。通过优化反应体系，最佳条件为:抗原包被浓度1μg/mL，包被液为pH8.5的Tris-HC1缓冲液，待检血清稀释倍数为400倍，酶标二抗稀释倍数为2000倍，样品稀释液为含0.05％吐温-20的磷酸盐缓冲液(PBST)，封闭液为含0.1％BSA的PBS，待检血清反应时间为60min，酶标二抗反应时间为45min，底物反应时间为10min。Rep抗体阴性、阳性血清判定的临界值为S/P值等于0.12。该方法与猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合症病毒、猪伪狂犬病毒阳性血清无交叉反应。批内变异系数为1.15％-9.91％，批间的变异系数为0.91％-9.00％。符合试验结果显示，本研究建立的间接ELISA方法与IFA的阳性符合率为92.66％，阴性符合率为100％，总符合率为93.14％。　　 本研究从浙江、江西和江苏三省的16个猪场中分离到7株PCV2病毒，利用邻接法分析其基因型归属，结果显示，本研究所分离HYan09与NBiao10毒株具PCV2b标签序列，但却属于PCV2a。利用最大简约法、极大似然法、贝叶斯法对其系统进化树进行验证，得到了同样的结果。ORF2全长序列比对显示，上述两分离株并非重组病毒，将其归为一新亚型PCV2a/2F。另外5株PCV2属于PCV2b/1C。