APOBEC3家族蛋白对逆转录转座子LINE-1和SVA的调控研究

来源 :天津大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kyleSun81
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逆转录转座子LINE-1是一类可在基因组中自主移动的元件。人类基因组中有34%以上的序列来源于LINE-1的大量扩增。目前已被证实,LINE-1所编码的核酸内切酶可造成DNA双链断裂,引起基因组的不稳定。此外,LINE-1在基因组中的逆转座可导致疾病的发生。  哺乳动物细胞已经进化出一系列的防御机制用以调控逆转录转座子在基因组中的转座并试图减弱该转座所引起的不利影响。人的胞嘧啶脱氨酶APOBEC3是细胞内逆转录转座子防御系统中一类新兴的家族蛋白,它已经被证实可以调控35%-99%的LINE-1逆转座活性。然而,除A3A蛋白之外,在其他APOBEC3家族蛋白调控LINE-1逆转座的过程中并未检测到G-A的超突变,这说明存在一种或多种脱氨酶非依赖型的抗LINE-1机制。  本研究探讨了APOBEC3家族蛋白抑制机体逆转座的作用及其机制。研究表明:除A3G蛋白之外,A3家族蛋白均可以不同程度地调控LINE-1逆转座活性,但是该调控作用不单为A3蛋白与LINE-1 ORF1p之间的相互作用或共定位结果。借助成熟完善的LEAP实验,我们发现A3家族蛋白可以选择性地靶向LINE-1 RNP进而实现对LINE-1 ORF2p逆转录酶活性的抑制。另外在研究中我们还发现,A3B、A3DE和A3H_HapII以CDD或RNA-binding pocket domain非依赖型的方式实现对LINE-1逆转座活性的调控。这说明APOBEC3家族蛋白抑制逆转录病毒HIV-1和逆转录转座子LINE-1的机制不同。  本研究证实,所有的APOBEC3家族蛋白是非自主性逆转录转座子SVA的抑制因子。虽然A3G不具备抑制LINE-1逆转座活性的能力,但是对SVA逆转座活性具有抑制作用,说明A3家族蛋白对LINE-1和SVA采取了不同的调控机制。同时,我们还揭示了APOBEC3H不稳定单倍型具有抑制SVA逆转座活性的功能,该表明APOBEC3H基因在选择性进化历程中保留了对某些逆转座子调控的特性。  综上,本研究系统地探究了APOBEC3家族蛋白对逆转录转座子LINE-1和SVA的调控作用,揭示了APOBEC3参与调控逆转录病毒HIV-1和逆转录转座子的不同机制,发现了APOBEC3H不稳定单倍型(HapI、HapIII、HapIV和HapVI)具备抗SVA的功能。本研究对全面理解APOBEC3家族蛋白调控逆转录元件提供了实验依据,为探索APOBEC3作为广谱抗病毒因子的功能提供了新思路。
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