目的:研究盐酸小檗碱（Berberine hydrochloride,BBR）在三阴性乳腺癌MDA-MB-231细胞中是否能作为去乙酰化酶抑制剂（Lysine（K）deacetyltransferase inhibitor,KDACi）抑制沉默信息调节因子2相关酶2（Silent Information Regulator Factor 2 Related Enzyme 2,SIRT2）表达,从而提高NF-κB的P65亚基乙酰化水平,进而诱导MDA-MB-231细胞凋亡发生的分子机制。方法:首先对SIRT2蛋白进行活性预测,然后获取SIRT2的晶体结构、BBR的化学结构,应用计算机虚拟分子对接技术证明BBR对SIRT2的药物作用,将BBR与SIRT2进行分子对接。CCK-8法检测BBR对细胞增殖的影响及计算出不同时间的IC50,得出BBR后续实验浓度（25μM、50μM、100μM）。以NF-κB为桥梁检测BBR对三阴性乳腺癌细胞的药物作用及分子机制,RT-PCR检测细胞内P65、BAX、BCL2 m RNA水平的改变;Western Blot检测细胞内SIRT2蛋白表达、NF-κB P65、乙酰化P65（Ac-P65）、磷酸化P65（p-P65）及其下游底物BAX、BCL2、Caspase-9、Caspase-3蛋白水平的改变;JC-1染色检测线粒体膜电位（MMP）改变;流式细胞仪检测细胞凋亡;克隆形成实验检测BBR对细胞群体依赖性和增殖能力的影响;划痕实验、Transwell迁移实验检测细胞的迁移能力的影响。结果:计算机虚拟分子对接结果显示SIRT2作为药物可及性最好的蛋白,能够与BBR进行很好的结合。CCK8实验结果表明BBR能够浓度依赖性的抑制MDA-MB-231的增殖,24、48、72h的IC50值分别为106.865±13.541μM、56.015±12.482μM、51.681±17.511μM;并选定BBR作用48h后得出1/2IC50、IC50、2IC50的浓度（25μM、50μM、100μM）进行后续实验。RT-PCR结果表示与对照组比较,BBR在m RNA水平上能够明显促进NF-κB（P65）的升高（P＜0.05）,BAX的升高以及BCL2的下降（P＜0.05）。Western Blot结果显示当BBR降低SIRT2蛋白表达水平,NF-κB（P65）蛋白作为其底物,乙酰化修饰水平上升（P＜0.05）并且磷酸化修饰水平下降（P＜0.05）。P65的底物促凋亡蛋白BAX表达增加,抗凋亡蛋白BCL2表达降低（P＜0.05）,BAX/BCL2的比率增加,诱导Casepase-9的活化增加从而介导Caspase-3的剪切,JC-1染色证明线粒体膜电位受损。Annexin V/PI的检测证明BBR导致凋亡的发生。克隆形成实验证明BBR能够浓度依赖性的抑制MDA-MB-231细胞增殖;Transwell实验结果与划痕实验结果都证明BBR能够明显抑制细胞迁移和转移（P＜0.05）。结论:BBR能够与SIRT2形成良好分子对接,通过抑制SIRT2蛋白表达,降低SIRT2对P65的去乙酰化作用,使得乙酰化P65蛋白增加并募集下游凋亡相关基因活化,促进三阴性乳腺癌细胞凋亡,BBR具有潜在的KDACi活性和抗肿瘤活性。