胃癌血清适配子对胃癌诊断价值的研究

来源 :南昌大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ytm_2009
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景与目的目前胃癌的筛查性诊断主要依赖胃镜,但是胃镜为有创性检查,且费用较高,部分患者因恐惧而不愿接受胃镜检查。血清肿瘤标志物检测是简便易行的肿瘤筛查诊断方法,但目前仍缺乏有临床价值的胃癌标志物。适配子是一种生物分子的单链核酸配体,通过指数扩增的配体系统进化(SELEX)技术从人工合成的单链随机寡核苷酸文库中筛选获得,能高特异性、高亲和力结合靶分子,用于疾病诊断具有良好的应用前景。本课题组在前期研究中,以胃癌血清为靶标进行了10轮适配子筛选,克隆分离出一批适配子,其中部分适配子与胃癌混合血清的结合程度大于与正常混合血清,但对胃癌诊断价值并不理想。为此,本研究在前期筛选的基础上继续筛选特异性更好的适配子,然后进行基于适配子的胃癌诊断研究,为建立新的胃癌筛查性诊断新技术奠定基础。方法:1.血清标本收集及混合血清的制备:收集南昌大学第一附属医院2012-2013年间就诊的胃癌、非萎缩性胃炎、消化性溃疡病人和参加体检且各项检查均正常的健康人的血清标本,-80℃保存备用。随机取胃癌血清标本15例等量混合制备胃癌混合血清,同法制备正常混合血清。2.胃癌血清适配子的再筛选和分离:以前期第10轮胃癌血清适配子筛选后的亚文库继续进行SELEX筛选,并采用聚丙烯酰胺电泳逐轮监测亚文库条带的集中度和特异性,并据此确定筛选终点。选择与胃癌混合血清有特异性结合的适配子亚文库进行对称PCR扩增,送生物工程公司克隆测序,分离适配子。3.胃癌血清适配子的鉴定:采用RNAStructure4.6软件模拟分析所分离适配子的二级结构。选出二级结构少且自由能低的适配子进行人工合成,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳及灰度分析法先确定适配子与血清标本作用时两者的合适用量,再小样本血清标本鉴定适配子与胃癌血清结合的特异性,即将适配子分别与胃癌和正常血清标本各16例孵育、聚丙烯酰胺凝胶电泳和GelRed染色,测定游离带的灰度值,计算其与适配子对照的比值。胃癌组灰度比值小于正常组且差异有统计学意义者为胃癌血清特异性适配子。4.荧光法评价适配子对胃癌的诊断价值:选出对胃癌血清有一定特异性的适配子,采用本课题组建立的荧光法来评价它们对胃癌的诊断价值。在确定适配子及血清的合适用量后,随机挑选胃癌、正常血清标本各15例,初步筛选对胃癌有诊断价值适配子。选择组间有差异且诊断胃癌的AUROC在0.9以上的适配子,荧光法小样本(胃癌、正常血清标本各32例)验证它们对胃癌的诊断价值。对小样本验证有价值的适配子再扩大样本(胃癌、良性胃病、正常血清各100例左右)确认它们对胃癌的诊断价值。同时以结合缓冲液代替适配子测定血清标本的本底荧光值。单独和联合分析适配子、血清本底荧光值诊断胃癌的AUROC和效能(敏感度、特异度、准确度、阳性预测值、阴性预测值、阳性似然比和阴性似然比)。结果:1.胃癌血清适配子的再筛选和分离:再筛选过程中,电泳显示亚文库条带逐渐集中,与胃癌混合血清结合的特异性呈不断增强趋势,至第18轮时停止筛选。取第14~18轮的亚文库分别送公司克隆,共分离出160个适配子。2.胃癌血清适配子的鉴定:二级结构模拟分析显示所分离的适配子有丰富的二级结构,其中21个适配子的二级结构多样性少于2种。小样本血清标本鉴定显示,21个适配子中有11个的胃癌组游离条带灰度比值小于正常组,且组间差异有或接近有统计学意义(P<0.1),即胃癌血清特异性适配子。3.适配子对胃癌的诊断价值:将上述11个胃癌血清特异性适配子分别与胃癌、正常血清标本各15例孵育后测定荧光值,结果显示有3个适配子(AP-GCS-15-16、AP-GCS-16-17、AP-GCS-17-16)诊断胃癌的AUROC达到0.9以上。将这3个初筛对胃癌有良好诊断价值的适配子进行小样本验证(胃癌、正常血清各32例),结果显示适配子AP-GCS-15-16、AP-GCS-17-16诊断胃癌的AUROC均在0.7以上。对这2个适配子扩大样本(胃癌106例、良性胃病84例、正常血清94例)验证它们对胃癌的诊断价值,结果显示适配子AP-GCS-15-16的荧光值在胃癌组与良性胃病组和正常组均有统计学差异(P<0.001),而良性胃病组与正常组间无统计学差异(P>0.05),诊断胃癌的AUROC达到“良好”水平(0.880),敏感度为70.8%,特异度为84.9%,准确度为79.6%,但AP-GCS-17-16只有0.656。此外,血清本底荧光对胃癌的诊断价值有限,AUROC只有0.632。4.适配子联合分析对胃癌的诊断价值:联合分析可提高对胃癌的诊断价值。AP-GCS-15-16与血清本底荧光联合检测诊断胃癌的AUROC从0.880提高至0.920,敏感度为89.6%,特异度为81.5%,确准度为84.5%;AP-GCS-17-16与血清本底荧光联合检测诊断胃癌的AUROC从0.656提升至0.725;AP-GCS-15-16与AP-GCS-17-16联合分析诊断胃癌的AUROC为0.885,无明显提高。结论:(1)通过SELEX技术再筛选,成功获得一组胃癌血清适配子,其中部分适配子能与胃癌血清一定程度地特异性结合。(2)通过荧光法筛选出了对胃癌有诊断价值的适配子,其中适配子AP-GCS-15-16单用对胃癌有良好的诊断价值,与血清本底荧光联合检测可进一步提高其诊断价值。(3)胃癌血清的本底荧光值高于良性胃病和正常血清,但对胃癌的诊断价值有限,与适配子联合分析可提高其诊断价值。
其他文献
开展了含上部黏土层、饱和砂土层、密实砂土层的可液化自由场地在水平地震动激励下的大型振动台模型试验研究,分析了地震动激励时饱和砂土液化后场地加速度、位移、孔压比时
为遏制中国和平崛起,持续保持已有的军事和技术优势,在战略重心转移亚太的大背景下,美陆军正式提出了"多域战"概念,得到其他军种响应,并共同拟为应对弹道导弹齐射等威胁而采
从2009年开始有了增值税转型后,我国即从生产型转为消费型,这大大促进了行业积极性,同时也为企业优化产业链及设备升级提供了资金。为了加大促进经济增长2012年开始建立营改增扩
目的:研究和改进甜蜜素含量测定方法。方法:在国标测定方法的基础上,用氢氧化钠试液中和正己烷提取液中残留的硫酸,消除造成样品溶液不稳定的因素,用毛细管柱气相色谱法测定
烧结煤的破碎系统是烧结煤燃料准备工艺的组成部分,该系统在生产过程中会产生煤的粉尘,造成环境污染,对环境治理的环保除尘系统一般采用布袋式除尘,引风机收集粉尘的方法,通
目的通过Meta分析,讨论吉西他滨(GEM)联合替吉奥(S-1)和吉西他滨单药化疗在晚期胰腺癌治疗中的意义。方法计算机检索PubMed、Cochrane Library、EMBASE、中国知网数据库、中国生物
今年两会期间,国务院总理李克强在《政府工作报告》中明确,今年将全面实施营改增。自2016年5月1日起,我国全面推开营改增试点,将建筑业、房地产业、金融业、生活服务业全部纳入营
报纸
随着城市商业的发展,原有"百货型"的商业模式逐渐落伍,新的商业设计模式出现,商业项目在设计中由一味地追求销售面积,转换为对公共空间的打造和发展。公共空间在商业建筑中发挥
随着电子信息、计算机和智能控制等高新技术与工业制造技术的深度融合,工业生产正大踏步地进入“工业4.0”时代。坚强的通信设施是制造业升级的关键,而现有工业通信方式由于
美国国家实验室在成立的半个多世纪以来,取得了瞩目的科研成果和创新绩效,在维护美国国家安全以及领先优势地位方面,发挥了不可替代的作用。近年来,这些美国国家实验室的创新