基于机器学习的MRI影像组学模型预测直肠癌淋巴结转移的初步研究

来源 :兰州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fngdi
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:探讨基于多种机器学习分类器建立磁共振表观扩散系数图(apparent diffusion coefficient,ADC)的影像组学模型对直肠癌淋巴结转移的术前诊断价值。材料与方法:回顾性分析2017年11月至2019年11月在兰州大学第一医院经手术病理证实为直肠癌并于术前2周行直肠MRI检查的80位患者的临床和影像资料。按照7∶3的比例随机分成训练集56例和测试集24例。连续性收集2020年2月至2021年11月期间因穿刺活检为直肠癌患者的临床及影像资料,每位患者均行直肠MRI扫描并在两周内行根治手术,经排除后最终纳入31名患者组成验证集。使用A.K.软件对所有患者的ADC图进行图像预处理,然后导入开源软件ITK-SNAP对原发病灶进行VOI的勾画,使用pyradiomics软件提取所有VOI的组学特征。采用Spearman相关性分析和岭回归算法筛选与直肠癌淋巴结转移最具相关性的影像组学标签建立单纯组学模型,将临床特征及MR报告情况进行单因素Logistic回归分析,保留P<0.1的特征与影像组学标签相结合建立临床-组学模型,使用5种不同的机器学习分类器通过五折交叉验证在训练集中训练,并在测试集、验证集中采用受试者工作特征曲线(ROC)的曲线下面积(AUC)、准确度、特异度、灵敏度、精准度和F1-score评价分类器的分类效果。使用Delong检验进行模型、分类器间AUC比较。结果:1.基于ADC图像的影像组学各模型及分类器对直肠癌区域内淋巴结转移状态的分类性能存在差异,综合训练集和测试集各分类器的表现,Bayes gaussian分类器是单纯组学模型中几种分类器表现较好的分类器(0.901(0.816-0.985),0.667(0.500-0.833));MLP分类器是临床-组学模型中几种分类器中表现较好的分类器(1.0(1.0-1.0),0.743(0.591-0.895))。2.通过比较单纯组学模型和临床-组学模型中个分类器在训练集、测试集和验证集的accuracy、F1-score值,可以得出无论是单纯组学模型还是临床-组学模型,Bayes gaussian分类器在训练集、测试集和验证集中的accuracy、F1-score值都较为均衡。3.训练集中只有SVC分类器的临床-组学模型的AUC显著高于单纯组学模型(P<0.05),但在测试集和验证集中,SVC分类器及其他分类器的单纯组学模型和临床-组学模型之间的对比P值均大于0.05。结论:1.基于DWI序列ADC图像的影像组学特征对术前预测直肠癌淋巴结转移有较好的预测性能,增加临床特征在多数分类器中并不能提高预测的准确性。2.多种分类器之间相互比较,无论单纯组学模型还是临床-组学模型在术前预测直肠癌淋巴结转移时,Bayes gaussian分类器在各个数据集中均表现良好,并且分类性能也较好。
其他文献
目的探讨MRI影像特征对低、中高级别前列腺癌(Prostatic cancer,PCa)Gleason分级的预测价值。方法回顾性分析2018年1月至2020年6月在兰州大学第一医院经过穿刺活检或根治术后病理证实为PCa的54个病人,63个病灶。纳入患者的年龄、前列腺特异性抗原(Prostate specific antigen,PSA)及其相关指标、以及病灶在T2WI图像上的定量及定性影像特征。采
目的:基于生物信息学分析和临床数据分析,探究DNA甲基化转移酶(DNMTs)基因在急性髓系白血病(AML)中的表达和突变及其与AML生存、预后和生物学行为的关系,挖掘其作为AML预后预测生物标志的潜在价值。方法:1)从GTEx数据库获取正常外周血/骨髓样品的基因表达数据,与TCGA数据库中AML相关基因表达数据整合,利用R软件进行DNMTs表达差异分析。2)在GEPIA数据库中,运用Pearson
目的通过构建H22肝癌荷瘤小鼠模型,研究阿克替苷对肝癌小鼠皮下移植瘤的抑制作用,并进一步探讨其作用机制。方法1.构建H22肝癌荷瘤小鼠模型,随机分为5组:空白对照组(生理盐水0.2ml)、阿克替苷低、中、高剂量组(40mg/kg、80mg/kg、160mg/kg)和阳性对照组(顺铂2mg/kg),所有小鼠均采用腹腔注射方式给药,每周连续给药5天,共用药2周。2.给药期间动态观察并记录各组肝癌小鼠精
目的 采用二维剪切波弹性成像(2D-SWE)技术分析乳腺癌放疗患者臂丛神经的弹性特征,并与健康志愿者进行比较,以评价其弹性特征能否作为放疗患者臂丛神经受累的早期诊断依据,并分析乳腺癌患者放疗后随访时间、臂丛照射体积及照射剂量与臂丛神经弹性模量值、剪切波速度(SWV)的相关性。方法 本研究纳入乳腺癌术后放疗患者84例及健康女性志愿者40例。采用高频超声测量臂丛神经厚径、周长及横截面积,应用2D-SW
目的:研究治疗前18F-FDG PET/CT显像的多个代谢参数在ENKTL预后判断中的价值。方法:回顾性分析2016年1月至2021年2月期间在兰州大学第二医院就诊的45例ENKTL患者,其中男性患者32例,女性患者13例,年龄17-79岁,所有ENKTL患者在治疗前均接受了18F-FDG PET/CT全身扫描。采集ENKTL患者病灶各代谢参数,包括SUVmax、SUVmean、MTV和TLG;收
目的探讨能谱CT定量参数评估C6脑胶质瘤放疗联合地塞米松对于肿瘤实体增殖抑制、及肿瘤免疫微环境的动态监测研究。方法及材料100只雄性Wister大鼠,右侧基底节种植C6胶质瘤细胞,接种后第14(T0时间点)、20(T6时间点)、26(T12时间点)天能谱CT增强扫描,T0时间点确定98只大鼠成瘤,预实验24只荷瘤鼠随机分为四组用于生存观察,74只大鼠随机分为四组,即对照组(A组),地塞米松治疗组(
目的:回顾性分析接受单侧人工耳蜗植入患者的临床资料,分析残余听力与内耳形态的相关性,探究术前残余听力对CI术后疗效的影响,揭示术前残余听力对CI患者术后听觉言语康复效果评估的价值。方法:选取2012年-2015年于兰州大学第二医院耳鼻咽喉头颈外科接受单侧人工耳蜗植入术的383例患者,收集患者的临床资料,按Sennaroglu内耳畸形分类标准将所有患者分为内耳结构正常组、EVA畸形组、EVA+IP-
目的:通过研究多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)患者血清微小核糖核酸146a(micro RNA-146a,mi R-146a)的相对表达水平、外周血辅助性T细胞9(T helper cell 9,Th9)、辅助性T细胞17(T helper cell 17,Th17)比例及细胞因子白细胞介素9(interleukin-9,IL-9)、白细胞介素17(interleukin-1
目的:探讨能谱CT定量参数(碘浓度、单能量CT值、能谱曲线斜率)能否评价大鼠C6脑胶质瘤模型放疗联合替莫唑胺(temozolomide,TMZ)的疗效。方法:健康雄性wister大鼠50只在其脑内进行C6胶质瘤细胞接种后建立大鼠C6脑胶质瘤模型;接种第14天对大鼠进行能谱CT增强检查观察成瘤情况,将48只成瘤的大鼠随机分为对照组、TMZ组、放疗组、放疗联合TMZ组。各组干预均完成后的第1天、第7天
目的:评价MRI乳腺背景实质强化(background parenchymal enhancement,BPE)与乳腺癌的关系,并探讨BPE在乳腺癌不同分子亚型、免疫组化标志物及绝经状态中是否存在差异。方法:收集2018年10月至2020年12月间就诊于我院的86例确诊为单侧乳腺病变的患者为研究对象,年龄18~67岁(46.05±10.61岁)。良性病变30例,恶性病变56例。所有病灶结果均经手术