患溃疡病或正常猕猴桃内生及土壤细菌多样性及群落结构研究

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猕猴桃细菌性溃疡病一直是世界性难题,且至今未有完全有效的防治手段。本研究从都江堰地区红阳猕猴植株发病组织中成功分离出该病致病菌并利用传统分离方法、变性梯度凝胶电泳手段、及高通量测序技术探究患溃疡病猕猴桃与正常猕猴桃之间内生及土壤细菌群落结构及多样性差异。获得如下研究结果:传统培养分离结果显示,患病根际土壤细菌种群数量显著低于正常根际土壤细菌,且种系结构也存在差异,从猕猴桃种植土壤中筛选到10株具有明显抑菌活性的菌株,这些菌株在猕猴桃溃疡病的生物防治上有应用潜力;变性梯度凝胶电泳指纹图谱结果显示,患病枝条内生细菌Shannon多样性指数及Simpson多样性指数显著低于正常枝条,患病枝条内能够检测到微弱的溃疡病致病菌条带,该病原菌在正常枝条内检测不到,这进一步验证了丁香假单胞菌猕猴桃致病变种是猕猴桃细菌性溃疡病致病菌这一结论,而正常枝条内能够检测到拟杆菌门细菌,该菌在患病枝条内几乎检测不到,此外,患病枝条中大黄欧文菌组成比例较高、酸杆菌门组成比例较低;NGS结果显示,患病根际土壤Chao1多样性指数及ACE指数显著低于正常根际土壤;患病枝条Chao1指数、ACE指数、Shannon指数及Simpson指数显著低于正常枝条,寡养单胞菌属、Mizugakiibacter属在患病根际土壤中显著较高,链孢子囊菌属及立克次氏小体属在正常根际土壤中显著较低,假单胞菌属在患病枝条中较高,而甲烷菌属在正常枝条中较高,此外,土壤理化因子变化与细菌多样性变化显著相关。本研究揭示出都江堰地区患溃疡病红阳猕猴桃与正常红阳猕猴桃之间内生或根际土壤细菌多样性及群落结构差异,为今后猕猴桃细菌性溃疡病生物防治提供了有效参考。
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