衰老相关肠道特征菌群定量分析研究

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在前期研究的基础上,本课题针对与年龄相关的8个肠道特征菌种Citrobacter freundii,Alistipes putredinis,Bacteroides clarus YIT 12056,Catenibacterium mitsuokai,Phascolarctobacterium faecium,Eubacterium eligens,Eubacterium biforme DSM 3989和Prevotella sp.DJF_RP53,分别设计特异性引物,通过标准质粒和标准曲线的构建,建立实时荧光定量PCR分析方法,并对其在健康青年、老年粪便样本中的含量进行检测,确定其含量变化。共筛选出了4对可用于定量PCR检测的特异性引物。检测结果表明,Citrobacter freundii在健康老年肠道中的含量显著高于青年组(p<0.001);而Eubacterium biforme DSM 3989在健康青年肠道中含量则显著高于老年组(p<0.001);Phascolarctobacterium faecium虽在青年组肠道中含量高于老年组,但无显著性差异。针对Catenibacterium mitsuokai设计的引物扩增产物在健康青年肠道中含量显著高于老年组(p<0.05),但测序表明其并非Catenibacterium mitsuokai,而是另一类肠道优势菌群(YH1)。采用SPSS对四种特征菌进行主成分分析,提取了两个主成分,其中主成分1指向YH1和Phascolarctobacterium faecium,提取公因子后依然能较好反映菌群的年龄差异。判别分析结果表明,综合考虑四种菌群的判别符合率(89.5%)高于针对单一菌的判别符合率,可作为考察衰老相关的一个新的分子指标。本研究使用荧光定量PCR技术,通过对样本中各特征菌群的定量检测和统计分析,为快速判断肠道老化提供了新的检测方法,也为维护肠道健康及进一步的康复治疗奠定了基础。
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