随着市场经济在我国经济体系的不断壮大,财政收入不断增长,那么相应的政府投资规模也不断扩大,导致财政资金的管理重心从重视收入转变为财政支出管理,财政支出绩效评价成为公共体制改革的必然趋势。近几年国家对财政专项加大资金的投入力度更是逐年增强,就需要有相应的制度来规范和约束财政专项,发挥财政专项的重要作用。从目前情况看,我国在财政专项支出管理上相对滞后,有必要通过建立完善的财政专项绩效评价制度体系,促进财政专项管理水平不断提高,实现最大的经济效益和社会效益。本文在前期准备过程中阅读了大量的国内外参考资料,对相关的知识点和名词解释进行收集、整理,切实做到对概念的把握;根据财政专项支出的要求和所要达到的目的,通过财政专项绩效评价的背景和现状分析,依据公共财政理论及新公共管理理论等理论为基础,通过对西方发达国家的绩效评价的实践研究,对我国财政专项绩效评价现状分析后,借鉴适合我国财政专项的经验和实践,提出了构建科研事业单位财政专项绩效评价制度的必要性,总结出我国科研事业单位财政专项绩效评价的理论体系。有利于实现财政专项绩效评价成为实现有限财政预算资源综合效益最大化的重要途径。对提高我国科研事业单位财政专项绩效评价工作的水平具有很大的理论意义和现实意义。在研究方法上,通过绩效评价定性加定量分析、实例分析及关键绩效指标等方法,认真仔细的分析我国财政支出的特点,利用目标管理法对财政专项的经济性、效率性和效果性进行评价,建立组织实施、绩效评价过程及对绩效评价结果的应用的财政专项绩效评价的框架结构,构建一个适合我国科研事业单位财政专项绩效评价的指标体系和评价体系,选取适合我国科研事业单位财政专项绩效评价指标和评价标准,初步建立财政专项评价工作的标准和规范。为梳理和使用这个财政专项绩效评价体系的合理性和应用性,本文列举S省财政专项作为实例进行分析。使用上述所提到的绩效评价流程,对应用实例进行验证分析,得出了财政专项绩效评价的研究结果,一方面对我国财政专项绩效评价所存在的问题作了印证,另一方面为完善我国科研事业单位财政专项绩效评价的对策建议提供支持。