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本研究克隆得到了凡纳滨对虾的部分免疫相关基因细胞色素C(Cytochrome C，CY3、凋亡诱导因子(Apoptosis-inducing factor，AIF)、自噬蛋白（ATG5）、自噬相关蛋白(Microtubule associated protein1light chain3，LC3)的全长cDNA序列，并利用qPCR技术对上述基因的分子免疫应答特征进行了研究，采用Western Blot技术检测了Caspase3的调控变化，同时检测了WSSV刺后激凡纳滨对虾血细胞中ROS的含量变化，以期为对虾抵御病原侵染的免疫机制提供理论基础。主要结果如下: (1)细胞凋亡相关基因 CYC基因全长582bp，5非翻译区(UTR)为50bp，3UTR为217bp，开放阅读框(ORF)为315bp，编码104个氨基酸，包含一个Cytochrome_C结构域。CYC基因在肌肉、神经、大肠中表达量较高，在皮肤，胃和血液中表达丰度较低。WSSV刺激后，CYC基因和下游凋亡执行因子caspase3基因在肝胰腺和血细胞中均显著上调（P＜0.05）。Western Blot结果显示在肝胰腺中CYC的表达未发生明显变化，pro-caspase3和active-caspase3在病毒刺激后均呈现显著上调的变化趋势，在24h时变化最为显著(P＜0.05)。 AIF基因全长1664bp，5UTR为154bp，3UTR为187bp，ORF为1323bp，编码440个氨基酸，包含Pyrredox2和AIF C结构域。AIF基因在各组织中均有表达，其中在肠中的表达丰度最高，其次是肌肉;在鳃中的表达丰度最低，其次是神经和血细胞。WSSV刺激后，AIF基因在肝胰腺中表达显著上调(P＜0.05)，96h后回复到对照组水平;在血细胞中AIF的转录水平有所下降，其中24h和96h与对照组相比差异显著(P＜0.05)。 (2)细胞自噬相关基因 ATG5基因全长为1481bp，5UTR为96bp，3UTR为575bp，ORF为810bp，编码269个氨基酸，包含一个APG5结构域。ATG5基因主要在肌肉、皮肤中表达，在鳃中表达丰度最低。在肝胰腺组织中，凡纳滨对虾ATG5基因在病毒刺激24h后，与对照组相比显著上调，在刺激后其他时相与对照组均无明显差异(P＜0.05);病原刺激血细胞6h和48h后ATG5基因显著下调（P＜0.05），随后回复到对照组水平。此外，通过构建PGEX-4T-2-ATG5原核表达重组质粒，用大肠杆菌系统表达，得到其重组表达产物，发现PGEX-4T-2-ATG5重组蛋白主要在包涵体中进行表达。 LC3基因全长为945bp，5UTR为161bp，3UTR为343bp，ORF为447bp，编码148个氨基酸，包含一个APG12结构域。LC3基因主要在皮肤、大肠中表达，在血液中表达丰度最低。凡纳滨对虾肝胰腺组织经过WSSV刺激后，LC3基因的表达在刺激后48h显著下调(P＜0.01);血细胞经过病原刺激后，LC3基因在刺激后6h和48h后显著下调，在刺激后24h LC3回复到对照组水平，而在刺激96h后，显著上调(P＜0.05)。 (3)WSSV刺激后，ROS产量在刺激6h后达到最高值(P＜0.05)，为对照组的1.72倍，随着时间延长逐渐回复到对照组水平。