声波对菊花基因差异表达影响的初步研究

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研究表明,一些环境胁迫如干旱、水、盐、电场和机械刺激等能够诱导植物基因特异性表达。然而,作为自然界最为常见的一种环境胁迫——声音,其对植物基因表达影响的研究却不深入。有研究表明,声波作用不会导致植物遗传物质发生变异,而是在转录水平上造成基因表达方式发生改变。但声波作用后是植物的哪段基因片段响应声波刺激而表达方式变化还未见报道。本文以菊花作为实验材料,对声波处理后菊花基因的差异表达做初步研究。 本文首先提取了菊花总RNA。用1000HZ和100dB的声波处理经二次传代的菊花幼苗9天,每天60分钟。分别提取了处理组和对照组菊花的总RNA;结果表明,提取的总RNA浓度、纯度和完整性均很好,能够满足后续实验的要求;且声波处理组菊花总RNA得率要大于对照组(见表4.1)。 首先以提取的刺激组和对照组总RNA为模板,运用mRNA逆转录差异显示技术(DDRT-PCR)筛选受声波诱导的差异表达基因片段。在变性聚丙烯酰胺凝胶上分离到8个差异片段(见图5.7,5.8),分别为SA5-1、SA5-2、SA7、CA7、SC1、SC8-1、SC8-2、CG1;对上述8个差异片段重扩增后在琼脂糖凝胶上显示的结果表明,8个片段中只有SA5-2、SC1和SC8-1(见图5.9)三个片段分子量和变性聚丙烯酰胺凝胶上显示的条带分子量一致。 为了进一步确定SA5-2、SC1和SC8-1是否为真正受声波诱导而表达的条带,对其进行了Northern点杂交。结果表明,SA5-2和SC8-1与声波处理组菊花总RNA杂交后在胶片上清晰显影,而SC1则不显影(见图5.10,5.11,5.12)。说明SC1为假阳性,而SA5-2和SC8-1为阳性条带。其中SC8-1是受到声波处理后而特异性表达的,而SA5-2是优势表达条带。其分子量分别约为270bp和290bp。可以进一步对其克隆,分析序列和功能描述。 分析菊花和拟南芥经声波处理后产生的差异条带。经比较发现,菊花中的特异片段SA5-2和拟南芥中的特异片段SA3(见图5.13,5.14)有相似之处:扩增这两条条带的引物组合相近,锚定引物均为AAG CTT TTT TTT TTA,随机引物分别为AAGCTTAGTAGGC和AAGCTTTGGTCGA;分子量也接近,分别约为290bp和270bp,可以对其作进一步对比分析。
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